More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0320 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0320  transporter, major facilitator family protein  100 
 
 		 474 aa  935    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04410  arabinose efflux permease family protein  65.82 
 
 		 472 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.684912 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1748  major facilitator superfamily permease  57.95 
 
 		 476 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000637074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0186  major facilitator superfamily MFS_1  51.35 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0082  major facilitator transporter  50.22 
 
 		 474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1011  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2320  putative membrane transport protein  31.75 
 
 		 483 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4123  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 488 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.625658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 494 aa  94.4  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5759  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.476223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3018  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000682578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1235  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 491 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.839802 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  25.35 
 
 		 511 aa  87.4  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2831  putative membrane transport protein  25.67 
 
 		 485 aa  86.7  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.017692  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.72 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.36 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.72 
 
 		 513 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3385  major facilitator superfamily transporter  25.81 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1295  putative membrane transport protein  25 
 
 		 500 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.345301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  23.81 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  23.81 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  23.81 
 
 		 513 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.12 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 		 513 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.81 
 
 		 513 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  22.99 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  22.58 
 
 		 507 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.48 
 
 		 513 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.48 
 
 		 513 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1775  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  34.02 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.394194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1507  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000169816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4127  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.773525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4068  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 484 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3460  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  30.41 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0137927  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2988  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.18 
 
 		 514 aa  78.6  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.01 
 
 		 513 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  26.37 
 
 		 568 aa  77.4  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 478 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.88 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3177  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.38 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000683833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.82 
 
 		 522 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 465 aa  76.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.88 
 
 		 478 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3263  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00113776  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25.49 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3518  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0261106  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2888  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.293011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4203  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.318181  normal  0.987085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1787  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.53 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3170  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.9 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.28 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0992  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 475 aa  75.5  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00829704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6826  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 523 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7243  putative transmembrane efflux protein  25.34 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.279533 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  26.94 
 
 		 465 aa  74.7  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.49 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4178  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3478  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  29.38 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.49 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2070  major facilitator transporter  21.9 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1230  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0992498 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 496 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4677  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5274  hypothetical protein  25.82 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.355684  normal  0.184804 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2707  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.61 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3140  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.36 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.85 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 509 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3491  drug resistance transporter, Bcr/CflA family  28.35 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00320112  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  25.06 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  25.44 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.3 
 
 		 508 aa  72  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.4 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2098  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  24.65 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.14 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.06 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2608  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.145364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0659  permease of the major facilitator superfamily  25.6 
 
 		 683 aa  71.2  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0907  major facilitator transporter  20.09 
 
 		 477 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0239598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2569  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.06 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2614  major facilitator superfamily transporter  27.16 
 
 		 487 aa  71.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.88 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5903  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 487 aa  70.5  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.68 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  25.06 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  28.22 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.39 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.58 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.02 
 
 		 510 aa  70.1  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1005  hypothetical protein  23.45 
 
 		 453 aa  70.1  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.407756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>