More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1282 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  66.53 
 
 		 495 aa  648    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  68.27 
 
 		 495 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 491 aa  978    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  67.92 
 
 		 495 aa  666    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  58.25 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  46.67 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  42.89 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  41.26 
 
 		 458 aa  339  7e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0265  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0258  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 458 aa  263  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 516 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 516 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.43 
 
 		 522 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.09 
 
 		 469 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  29.43 
 
 		 537 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 515 aa  126  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 480 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  25.81 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  25.78 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  25.54 
 
 		 582 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  25.54 
 
 		 582 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.81 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.25 
 
 		 585 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.2 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.48 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 520 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 500 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.78 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00238209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6468  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.88 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.44 
 
 		 474 aa  117  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.89 
 
 		 502 aa  116  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  25.9 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.68 
 
 		 493 aa  115  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5530  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 		 543 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214437  normal  0.30089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.49 
 
 		 534 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  28.25 
 
 		 457 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.82 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.78 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.5 
 
 		 525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1017  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 525 aa  109  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  27.51 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.13 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.06 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1129  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.38 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.943729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 		 520 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.74 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  25.45 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.79 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.7 
 
 		 521 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 465 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  27.47 
 
 		 522 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  30.73 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.38 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1726  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.94 
 
 		 521 aa  108  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.917815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.59 
 
 		 512 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  26.77 
 
 		 489 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4686  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.82 
 
 		 520 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000722288  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.25 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  27.01 
 
 		 490 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  27.83 
 
 		 513 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.88 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.51 
 
 		 471 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.23 
 
 		 530 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2817  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  25.65 
 
 		 520 aa  106  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.05627  normal  0.701384 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 		 658 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.1 
 
 		 539 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6604  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 515 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  27.16 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4689  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200154  hitchhiker  0.00098784 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3498  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.699034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.34 
 
 		 517 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.18 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 512 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.69 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>