More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0479 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 463 aa  881    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  42.62 
 
 		 516 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 516 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  42.92 
 
 		 514 aa  286  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 515 aa  256  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.85 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 495 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 495 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  35.51 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.78 
 
 		 478 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  32.83 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  31.91 
 
 		 458 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 478 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.68 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.8 
 
 		 502 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 478 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  33.53 
 
 		 491 aa  171  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.83 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  34.1 
 
 		 469 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.61 
 
 		 529 aa  161  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  32.15 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.57 
 
 		 522 aa  160  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  33.09 
 
 		 519 aa  159  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  30.79 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5461  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5860  major facilitator transporter  31.99 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.28 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.81 
 
 		 585 aa  157  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.23 
 
 		 626 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 500 aa  156  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.38 
 
 		 496 aa  156  7e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  34.06 
 
 		 512 aa  156  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  31.9 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.33 
 
 		 528 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  33.53 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.74 
 
 		 529 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  27.01 
 
 		 582 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  27.01 
 
 		 582 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  27.01 
 
 		 582 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.43 
 
 		 498 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.6 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.47 
 
 		 458 aa  152  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.17 
 
 		 516 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 463 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.85 
 
 		 520 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  25.96 
 
 		 582 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.69 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.74 
 
 		 551 aa  147  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.24 
 
 		 541 aa  146  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 		 471 aa  146  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.32 
 
 		 452 aa  146  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.14 
 
 		 486 aa  146  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  35.94 
 
 		 457 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.6 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 500 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 543 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.14 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.72 
 
 		 489 aa  144  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.34 
 
 		 486 aa  143  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 498 aa  143  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.42 
 
 		 534 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 		 487 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 511 aa  143  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.53 
 
 		 488 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.81 
 
 		 521 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  36.84 
 
 		 444 aa  142  9e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 512 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 528 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.42 
 
 		 539 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 519 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 512 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2752  major facilitator transporter  35.06 
 
 		 498 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.4 
 
 		 508 aa  141  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.81 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 		 463 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.33 
 
 		 466 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 524 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 512 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0749958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>