More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3129 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  84.38 
 
 		 515 aa  783    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  100 
 
 		 514 aa  987    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  91.43 
 
 		 516 aa  882    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  85.34 
 
 		 516 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 		 463 aa  294  3e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 522 aa  214  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.16 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.39 
 
 		 532 aa  193  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.5 
 
 		 528 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 525 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  32.78 
 
 		 525 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 525 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.99 
 
 		 480 aa  186  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.57 
 
 		 478 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 478 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30 
 
 		 478 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.47 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 478 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.48 
 
 		 487 aa  180  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 518 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.76 
 
 		 486 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 509 aa  179  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 485 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 505 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.85 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1524  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 546 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.565851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.46 
 
 		 763 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.49 
 
 		 516 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.12 
 
 		 478 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 		 524 aa  173  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.44 
 
 		 539 aa  172  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 607 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.52 
 
 		 522 aa  171  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 		 527 aa  171  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.99 
 
 		 520 aa  171  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.96 
 
 		 458 aa  171  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  28.31 
 
 		 534 aa  169  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  28.51 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 529 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  31.27 
 
 		 533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  32.24 
 
 		 494 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 527 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 		 495 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 457 aa  166  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 528 aa  165  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.94 
 
 		 489 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 495 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.96 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  31.8 
 
 		 535 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  33.91 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 507 aa  163  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  31.3 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.52 
 
 		 503 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 574 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 		 509 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  28.63 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.85 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.12 
 
 		 521 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.73 
 
 		 458 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.72 
 
 		 532 aa  161  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5607  drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  31.93 
 
 		 475 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0864613  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.15 
 
 		 504 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  30.02 
 
 		 512 aa  160  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.66 
 
 		 530 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  28.3 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 500 aa  160  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.09 
 
 		 505 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 479 aa  159  9e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 512 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2323  transporter transmembrane protein  31.55 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 460 aa  159  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  29.18 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  26.81 
 
 		 554 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 		 520 aa  158  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.11 
 
 		 458 aa  158  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0323  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 525 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.853677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5160  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.23 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2252  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.16 
 
 		 529 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  normal  0.0232648 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.78 
 
 		 508 aa  157  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31.19 
 
 		 466 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2818  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 463 aa  156  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.561944  decreased coverage  0.0000285964 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2263  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 482 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330414  normal  0.0393067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>