More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1496 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0091  major facilitator transporter  69.89 
 
 
462 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1496  major facilitator transporter  100 
 
 
463 aa  897    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0094  major facilitator transporter  69.89 
 
 
462 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1525  major facilitator transporter  100 
 
 
463 aa  897    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.877887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2023  transporter, putative  58.23 
 
 
466 aa  541  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  57.42 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  57.42 
 
 
466 aa  539  9.999999999999999e-153  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1522  major facilitator transporter  52.84 
 
 
460 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0366872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1022  major facilitator superfamily MFS_1  50.32 
 
 
479 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.333797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  45.7 
 
 
458 aa  419  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0552  major facilitator transporter  44.05 
 
 
495 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767309  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1282  major facilitator superfamily permease  46.67 
 
 
491 aa  392  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0586  major facilitator superfamily MFS_1  42.92 
 
 
495 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0582  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 
495 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.19645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0265  major facilitator transporter  39.95 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0258  major facilitator transporter  39.95 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  31.53 
 
 
516 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.68 
 
 
522 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  31.13 
 
 
516 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  31.28 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0479  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 
463 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  28.1 
 
 
512 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  28.32 
 
 
512 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  27.4 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 
505 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  28.32 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  28.32 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  28.32 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  28.82 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  29.06 
 
 
512 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3656  major facilitator transporter  30.5 
 
 
515 aa  129  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00788445  normal  0.022371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 
478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 
502 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 
478 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.92 
 
 
484 aa  127  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.78 
 
 
488 aa  126  9e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2959  major facilitator transporter  28.29 
 
 
506 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2482  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.17 
 
 
493 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15461  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.7 
 
 
466 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.57 
 
 
500 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.72 
 
 
478 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 
522 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 
486 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 
486 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 
486 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  26.61 
 
 
457 aa  119  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.74 
 
 
541 aa  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 
486 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 
486 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 
486 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2353  major facilitator transporter  27.85 
 
 
529 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62279  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  27.76 
 
 
519 aa  117  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.54 
 
 
458 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  24.52 
 
 
534 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 
480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.3 
 
 
475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.75 
 
 
534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.01 
 
 
489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2213  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.927283  normal  0.0909458 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.47 
 
 
500 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 
483 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 
498 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
478 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.4 
 
 
502 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.95 
 
 
524 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.53 
 
 
458 aa  114  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02580  arabinose efflux permease family protein  25.18 
 
 
476 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  27.17 
 
 
462 aa  114  5e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0503  major facilitator superfamily permease  29.13 
 
 
568 aa  113  6e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.737729  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.79 
 
 
474 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0610  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.39 
 
 
464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.462732  normal  0.495513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12357  integral membrane transport protein  27.3 
 
 
537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.9 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 
485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
500 aa  111  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
509 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  24.63 
 
 
582 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  24.38 
 
 
582 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.57 
 
 
477 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 
512 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 
465 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  27.61 
 
 
511 aa  110  5e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.73 
 
 
471 aa  110  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.53 
 
 
486 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
520 aa  110  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.49 
 
 
508 aa  110  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.39 
 
 
503 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  24.47 
 
 
467 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  24.13 
 
 
582 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.13 
 
 
585 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 
505 aa  109  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  27.35 
 
 
452 aa  109  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.82 
 
 
538 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.05 
 
 
519 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
507 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  24.13 
 
 
582 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
522 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>