More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2125 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  100 
 
 		 507 aa  985    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 534 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  34.87 
 
 		 561 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  29.77 
 
 		 507 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  29.77 
 
 		 507 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.62 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.73 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.95 
 
 		 513 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 513 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 513 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  30.77 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.77 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  30.77 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.77 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.84 
 
 		 511 aa  191  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.53 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  30.77 
 
 		 511 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 511 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  35.95 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  28.98 
 
 		 511 aa  187  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.24 
 
 		 508 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 555 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 555 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  32.68 
 
 		 555 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.77 
 
 		 511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.29 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  33.88 
 
 		 502 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  33.27 
 
 		 511 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11439  aminoglycosides/tetracycline-transport integral membrane protein  32.03 
 
 		 518 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.252345  normal  0.125913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 682 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.53 
 
 		 504 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 682 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.53 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.03 
 
 		 569 aa  178  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.64 
 
 		 682 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.53 
 
 		 511 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.86 
 
 		 500 aa  176  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.57 
 
 		 539 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 676 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.36 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2329  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00827746  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.4 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32 
 
 		 528 aa  172  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.7 
 
 		 538 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 478 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.29 
 
 		 621 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  29.6 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.6 
 
 		 469 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.6 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  29.6 
 
 		 478 aa  169  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 480 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.79 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2691  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 		 528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.52 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.38 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 		 489 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.63 
 
 		 541 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.27 
 
 		 504 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 529 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.97 
 
 		 650 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3709  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.84 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.486595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.32 
 
 		 685 aa  164  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.46 
 
 		 615 aa  163  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.25 
 
 		 509 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.73 
 
 		 510 aa  163  7e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.32 
 
 		 467 aa  162  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.91 
 
 		 539 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.49 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.26 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.96 
 
 		 515 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 		 522 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3725  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112434  normal  0.052202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.06 
 
 		 509 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.57 
 
 		 515 aa  160  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.82 
 
 		 504 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.63 
 
 		 509 aa  160  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.79 
 
 		 530 aa  159  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.09 
 
 		 579 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.71 
 
 		 523 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.13 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 514 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
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NC_011886  Achl_1250  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.95 
 
 		 567 aa  158  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000544425 
 
 
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NC_009674  Bcer98_0558  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.11 
 
 		 538 aa  158  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000222683  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  31 
 
 		 535 aa  158  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.96 
 
 		 534 aa  157  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 476 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_4672  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 593 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349364  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.91 
 
 		 520 aa  157  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0388  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 532 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.32 
 
 		 530 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  28.21 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.66 
 
 		 697 aa  157  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
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