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for query gene Rcas_1960 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  92.08 
 
 
534 aa  890    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  100 
 
 
525 aa  1016    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  59.51 
 
 
512 aa  568  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  33.73 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  32.07 
 
 
555 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  32.07 
 
 
555 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  32.07 
 
 
555 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  34.35 
 
 
561 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  34.16 
 
 
511 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.22 
 
 
500 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11439  aminoglycosides/tetracycline-transport integral membrane protein  31.76 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.252345  normal  0.125913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2691  major facilitator superfamily transporter  33.26 
 
 
528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.18 
 
 
483 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  32.52 
 
 
502 aa  171  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1246  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 
487 aa  170  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.231482  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.08 
 
 
522 aa  168  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3725  major facilitator transporter  33.18 
 
 
521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112434  normal  0.052202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  34.84 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
529 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 
477 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1290  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.94 
 
 
477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.69 
 
 
569 aa  157  6e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33 
 
 
521 aa  155  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.62 
 
 
520 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 
521 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  32.36 
 
 
515 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0493  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.03 
 
 
478 aa  153  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.14 
 
 
511 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.43 
 
 
483 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 
478 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.33 
 
 
477 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.65 
 
 
508 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0411  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.77 
 
 
531 aa  150  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 
565 aa  150  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.47 
 
 
528 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1036  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.89 
 
 
672 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1009  major facilitator superfamily MFS_1  29.77 
 
 
460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00165429 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.33 
 
 
480 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2197  major facilitator transporter  29.15 
 
 
596 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.49 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  26.27 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.27 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 
511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.9 
 
 
483 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  28.77 
 
 
500 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 
666 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 
489 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.82 
 
 
483 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 
486 aa  147  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.65 
 
 
511 aa  147  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
448 aa  147  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2329  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
513 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00827746  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
480 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1619  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.93 
 
 
475 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344843  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.79 
 
 
697 aa  146  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.77 
 
 
504 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  26.05 
 
 
511 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 
474 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
495 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 
501 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 
526 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
528 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.148276  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.78 
 
 
513 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  29.98 
 
 
494 aa  144  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.49 
 
 
515 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.1 
 
 
479 aa  144  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3321  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 
650 aa  144  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.157992  normal  0.0742968 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.78 
 
 
513 aa  143  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  28.21 
 
 
501 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.79 
 
 
495 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5185  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30 
 
 
525 aa  143  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.804488  normal  0.490544 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 
592 aa  143  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.92 
 
 
482 aa  143  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 
524 aa  143  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2111  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.9 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534364  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  25.27 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  25.27 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.24 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
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NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.27 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
682 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.93 
 
 
535 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.88 
 
 
515 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  27.86 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  31.01 
 
 
474 aa  142  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.7 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
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NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.71 
 
 
478 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
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NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
682 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 
478 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_2768  MFS family transporter  30.39 
 
 
464 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.469352 
 
 
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NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.71 
 
 
478 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
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NC_013526  Tter_2612  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.81 
 
 
565 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000331464  n/a   
 
 
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NC_009051  Memar_0910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 
497 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0303117  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 
539 aa  141  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 
476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
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