More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0368 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 529 aa  1006    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  56.52 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  56.52 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  56.52 
 
 		 555 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11439  aminoglycosides/tetracycline-transport integral membrane protein  56.42 
 
 		 518 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.252345  normal  0.125913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2691  major facilitator superfamily transporter  56.63 
 
 		 528 aa  482  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3725  major facilitator transporter  56.79 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112434  normal  0.052202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  53.59 
 
 		 502 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  49.53 
 
 		 561 aa  382  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2329  major facilitator superfamily MFS_1  52.56 
 
 		 513 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00827746  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  49.61 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  46.31 
 
 		 513 aa  323  5e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 507 aa  204  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.82 
 
 		 534 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 512 aa  183  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 525 aa  178  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.01 
 
 		 456 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  25.87 
 
 		 511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.14 
 
 		 565 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.89 
 
 		 511 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.94 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2437  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 494 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.516021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.58 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  24.94 
 
 		 511 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2951  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 584 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.380575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3829  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.64 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000236934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.17 
 
 		 511 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.94 
 
 		 511 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.94 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4122  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.12 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000107671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4051  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.12 
 
 		 513 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000130909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 		 512 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3910  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000020213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4216  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.73 
 
 		 513 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3742  multidrug-efflux transporter  25.53 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000625397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3758  multidrug-efflux transporter  25.53 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000783495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1134  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.53 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000214385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4018  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.53 
 
 		 513 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4105  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.53 
 
 		 513 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.55 
 
 		 500 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24 
 
 		 511 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.03 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.83 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.3 
 
 		 458 aa  120  6e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.59 
 
 		 504 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  22.65 
 
 		 507 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  23.11 
 
 		 507 aa  117  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 		 509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1299  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 504 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1016  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 504 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80336  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.61 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0279  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 504 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.2584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0550  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 504 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.976745  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2533  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.37 
 
 		 504 aa  114  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4163  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 		 676 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1356  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.48 
 
 		 504 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.991135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 484 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.26 
 
 		 504 aa  113  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 497 aa  113  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.91 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.91 
 
 		 501 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.67 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.2 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 		 538 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.22 
 
 		 510 aa  110  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 685 aa  110  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0763  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.92 
 
 		 641 aa  109  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  27.21 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0017  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.59 
 
 		 528 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0275  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.66 
 
 		 539 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  29.42 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5244  major facilitator superfamily transporter  29.7 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4266  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.657921 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.36 
 
 		 495 aa  107  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0241  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 523 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.232516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 486 aa  107  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 569 aa  107  7e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.46 
 
 		 697 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.68 
 
 		 509 aa  106  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3539  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 608 aa  106  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.371134  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.59 
 
 		 495 aa  106  9e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 487 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.13 
 
 		 680 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3042  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.85 
 
 		 685 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.141693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>