More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2951 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2951  major facilitator transporter  100 
 
 		 584 aa  1103    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.380575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1500  major facilitator superfamily protein  52.54 
 
 		 513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.096158  normal  0.892962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3159  major facilitator superfamily MFS_1  50.26 
 
 		 511 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0359512  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2387  major facilitator transporter  52.35 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0964642  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2434  major facilitator superfamily transporter  52.35 
 
 		 555 aa  161  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.356291  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2428  major facilitator transporter  52.35 
 
 		 555 aa  161  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3011  Arabinose efflux permease-like protein  44.33 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  42.49 
 
 		 502 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11439  aminoglycosides/tetracycline-transport integral membrane protein  47.65 
 
 		 518 aa  138  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.252345  normal  0.125913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2329  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 513 aa  133  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00827746  hitchhiker  0.000157522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3725  major facilitator transporter  46.78 
 
 		 521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112434  normal  0.052202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2691  major facilitator superfamily transporter  45.93 
 
 		 528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0368  major facilitator superfamily MFS_1  43.41 
 
 		 529 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0632215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2928  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.32 
 
 		 534 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1960  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  37.08 
 
 		 517 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  37.08 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1102  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 512 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000316091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2125  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.81 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 		 528 aa  103  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03383  conserved hypothetical protein  32.59 
 
 		 579 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.292579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 486 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.02 
 
 		 485 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.53 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 489 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 		 523 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0295  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 		 565 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1176  major facilitator superfamily MFS_1  33.96 
 
 		 450 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 530 aa  98.6  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 573 aa  98.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  33.5 
 
 		 515 aa  98.2  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0169  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 496 aa  97.8  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 496 aa  97.4  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.54 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 495 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3186  drug transport protein, putative  30.65 
 
 		 507 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3811  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 512 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1061  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.09 
 
 		 493 aa  96.3  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0577736  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4140  major facilitator superfamily MFS_1  34.08 
 
 		 512 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347022  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  32.2 
 
 		 501 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3171  Mdr  29.15 
 
 		 507 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  38.75 
 
 		 489 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03264  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03320)  30.8 
 
 		 571 aa  95.5  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.591417 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1388  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 483 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4335  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.9 
 
 		 483 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0063  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.65 
 
 		 539 aa  95.1  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.2 
 
 		 540 aa  95.1  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2919  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.63 
 
 		 508 aa  95.5  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  30.61 
 
 		 511 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 483 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.08 
 
 		 511 aa  94  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.08 
 
 		 511 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2632  multidrug resistance protein B  31.65 
 
 		 511 aa  94  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000173688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.22 
 
 		 498 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.1 
 
 		 504 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.01 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.47 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.71 
 
 		 569 aa  93.2  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  31.65 
 
 		 511 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.73 
 
 		 504 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.65 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.7 
 
 		 505 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.65 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1309  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.16 
 
 		 528 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.576525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 532 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.74 
 
 		 511 aa  92.8  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2800  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 		 586 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0579957  hitchhiker  0.00000851422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2703  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.86 
 
 		 511 aa  92  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.445725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.51 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1028  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.34 
 
 		 483 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.06 
 
 		 478 aa  91.3  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.52 
 
 		 512 aa  91.3  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.37 
 
 		 535 aa  91.7  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 523 aa  90.9  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.36 
 
 		 524 aa  90.5  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.57 
 
 		 478 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.84 
 
 		 526 aa  90.1  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1278  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.52 
 
 		 472 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 539 aa  90.1  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0999  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.26 
 
 		 486 aa  89.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00068647  hitchhiker  0.00553022 
 
 
-
 
NC_004310  BR1059  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.15 
 
 		 513 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.186181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4302  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0414  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.444257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4177  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 469 aa  89  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.6 
 
 		 579 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.68 
 
 		 538 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.71 
 
 		 534 aa  88.6  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 541 aa  88.6  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4479  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 505 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1177  MFS permease  34.16 
 
 		 520 aa  88.6  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2019  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.77 
 
 		 524 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32634  multidrug-resistance transporte  28.72 
 
 		 607 aa  88.2  4e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.0035637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 548 aa  88.2  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3584  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.1 
 
 		 531 aa  88.2  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00201825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>