More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5066 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Alignment on homolog gene
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_5066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  100 
 
 		 532 aa  1064    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  46.6 
 
 		 525 aa  455  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0116  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.9 
 
 		 529 aa  448  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0107  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  45.7 
 
 		 529 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.905883  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1089  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.5 
 
 		 525 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.831472  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6770  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  47.67 
 
 		 522 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.057108  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1513  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.71 
 
 		 532 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.605454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.59 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.2 
 
 		 529 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0671945  normal  0.0275622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3712  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.94 
 
 		 532 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.368579 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.4 
 
 		 528 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0282921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4060  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.22 
 
 		 530 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.236372  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3836  MFS permease  45.89 
 
 		 525 aa  435  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.29674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4101  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.49 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.420872 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4583  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.04 
 
 		 525 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4469  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  45.49 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1981  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.64 
 
 		 528 aa  428  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0426587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.08 
 
 		 531 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3441  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.63 
 
 		 528 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.31 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.574057 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.72 
 
 		 524 aa  419  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506571  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_6187  putative multidrug resistance protein B  44.34 
 
 		 529 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.315728  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0745  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.63 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0553  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.4 
 
 		 516 aa  363  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4417  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.17 
 
 		 523 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022578  normal  0.743863 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4495  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.02 
 
 		 526 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0608194  normal  0.157501 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0737  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  39.96 
 
 		 523 aa  359  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299859  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5485  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 524 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3631  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 524 aa  359  7e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.84 
 
 		 536 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7472  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.87 
 
 		 543 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.88 
 
 		 516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.192048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3754  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.118599 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4609  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3769  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.96 
 
 		 524 aa  351  2e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4976  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.64 
 
 		 524 aa  350  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2345  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.87 
 
 		 524 aa  349  7e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4652  putative drug resistance transporter  38.9 
 
 		 508 aa  345  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.57 
 
 		 530 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.14668  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.51 
 
 		 511 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5666  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.93 
 
 		 512 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.456892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6611  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 513 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.103598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3453  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.14 
 
 		 519 aa  289  8e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3278  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.5 
 
 		 539 aa  288  1e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4713  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.19 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1975  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 516 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.211725  hitchhiker  0.00374336 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2017  MFS transporter  32.83 
 
 		 534 aa  286  5e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.775296  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3785  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.29 
 
 		 516 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0929459  normal  0.428314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1506  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.4 
 
 		 516 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.69 
 
 		 529 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.12 
 
 		 527 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5591  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 524 aa  282  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1876  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.27 
 
 		 516 aa  281  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.79 
 
 		 537 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0500  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.59 
 
 		 543 aa  280  4e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1991  MFS family transporter  32.9 
 
 		 519 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0403  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  36.57 
 
 		 529 aa  280  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3405  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.08 
 
 		 538 aa  279  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23520  putative MFS transporter  33.81 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0341451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2736  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.01 
 
 		 517 aa  276  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.545703 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00460  transport protein  32.8 
 
 		 528 aa  275  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0564548  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1607  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.9 
 
 		 535 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.798645  hitchhiker  0.000105098 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.91 
 
 		 517 aa  274  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1714  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.91 
 
 		 532 aa  273  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.140819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6590  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.29 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.236346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.13 
 
 		 535 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.07 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0525  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  34.76 
 
 		 539 aa  271  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0524  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 535 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2981  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.96 
 
 		 540 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3842  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 542 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3968  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 542 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3786  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 542 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0483  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.73 
 
 		 542 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0204  putative multidrug resistance protein  33.71 
 
 		 539 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0835  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.82 
 
 		 536 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.861502 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3596  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 516 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.93 
 
 		 532 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.52 
 
 		 526 aa  265  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3508  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.87 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.87525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.78 
 
 		 526 aa  262  8.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3361  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.26 
 
 		 535 aa  262  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182834  hitchhiker  0.000000000000491163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0955  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.18 
 
 		 539 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4967  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 527 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3193  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.88 
 
 		 527 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146244  normal  0.252791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.92 
 
 		 520 aa  259  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 515 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3794  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354181 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.47 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0453  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.66 
 
 		 526 aa  257  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3275  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.58 
 
 		 528 aa  258  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2192  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.8 
 
 		 528 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.024166  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.56 
 
 		 517 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3900  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.645893  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_4466  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.87368  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3627  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.07 
 
 		 528 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.126338  normal  0.617009 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.78 
 
 		 515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_007493  RSP_0229  multidrug efflux pump, MF superfamily  35.74 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B2927  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.87 
 
 		 530 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401426  normal  1 
 
 
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