More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4177 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4302  major facilitator transporter  79.91 
 
 		 466 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4177  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 469 aa  925    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2021  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  72.69 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2247  major facilitator superfamily MFS_1  72.23 
 
 		 466 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6615  EmrB/QacA family drug resistance transporter  67.83 
 
 		 501 aa  616  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5832  major facilitator transporter  64.68 
 
 		 462 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4471  major facilitator transporter  64.68 
 
 		 462 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.475899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3897  major facilitator transporter  63 
 
 		 494 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4164  EmrB/QacA family drug resistance transporter  64.8 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.711123 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1409  major facilitator transporter  65.24 
 
 		 462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3908  major facilitator transporter  63.22 
 
 		 462 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4370  major facilitator transporter  64.11 
 
 		 462 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.701723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.05 
 
 		 528 aa  524  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0547  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.77 
 
 		 489 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.387969 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0779  major facilitator superfamily drug efflux pump  52.93 
 
 		 482 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.497284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3187  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.39 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500903  normal  0.0852056 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2454  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.46 
 
 		 478 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000627963 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5867  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.87 
 
 		 494 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330086  normal  0.29148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4826  EmrB/QacA subfamily transporter  53.57 
 
 		 484 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0325422  normal  0.202323 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53 
 
 		 489 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0492879  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2536  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.08 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0171268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2560  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.08 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115915 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0759  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.9 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260682  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2259  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.36 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.41183  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0945  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  53.36 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1095  MFS transporter  53.61 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0752  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.74 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2136  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  53.36 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1924  EmrB/QacA family drug resistance transporter  54.08 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0556  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  53.36 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.601964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0941  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  53.36 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.13812  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4675  major facilitator superfamily MFS_1  51.19 
 
 		 476 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610966  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4865  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.9 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4048  major facilitator superfamily transporter  53.04 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.54 
 
 		 480 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0730599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1665  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.9 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.85594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2090  major facilitator superfamily transporter  52.9 
 
 		 478 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.126245  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4240  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.03 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4128  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.03 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.422777  normal  0.15166 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3040  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  49.67 
 
 		 469 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.071182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05323  transporter transmembrane protein  48.3 
 
 		 476 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2687  multidrug efflux system protein MdtE  46.61 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.906977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1763  putative MFS transporter  48.23 
 
 		 474 aa  382  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.66 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2705  multidrug efflux system protein MdtE  45.51 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.11232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  44.03 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4279  inner membrane transport protein YieO  43.81 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124097  normal  0.840989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4220  inner membrane transport protein YieO  43.81 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4099  inner membrane transport protein YieO  43.81 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0149395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4114  inner membrane transport protein YieO  43.81 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00252158  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3555  multidrug efflux system protein MdtE  46.32 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2359  multidrug efflux system protein MdtE  46.19 
 
 		 470 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2315  multidrug efflux system protein MdtE  46.19 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2259  multidrug efflux system protein MdtE  46.19 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.716187  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2366  multidrug efflux system protein MdtE  46.19 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.505181 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2475  multidrug efflux system protein MdtE  46.19 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.829897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  42.64 
 
 		 475 aa  364  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  42.43 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.43 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  42.43 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  42.43 
 
 		 475 aa  363  3e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  42.37 
 
 		 475 aa  362  8e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1309  multidrug efflux system protein MdtE  44.42 
 
 		 466 aa  362  1e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4269  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  43.11 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000116309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  42 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.22 
 
 		 475 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1212  multidrug efflux system protein MdtE  45.18 
 
 		 465 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.5282e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1329  multidrug efflux system protein MdtE  45.18 
 
 		 465 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3100  multidrug efflux system protein MdtE  45.18 
 
 		 465 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2970  multidrug efflux system protein MdtE  45.35 
 
 		 466 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.92 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1203  multidrug efflux system protein MdtE  45.53 
 
 		 467 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01982  multidrug efflux system protein  45.22 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1579  major facilitator superfamily MFS_1  45.22 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.383326  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01974  hypothetical protein  45.22 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2219  multidrug efflux system protein MdtE  45.22 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1156  multidrug efflux system protein MdtE  45.22 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1564  multidrug efflux system protein MdtE  45.22 
 
 		 471 aa  349  7e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886181  normal  0.734188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0983  multidrug efflux system protein MdtE  45.22 
 
 		 471 aa  348  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.500741  normal  0.355503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3017  multidrug efflux system protein MdtE  45.22 
 
 		 471 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.103244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05990  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.26 
 
 		 477 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.05141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2369  multidrug efflux system protein MdtE  45.01 
 
 		 471 aa  346  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0562  MFS family transporter  43.26 
 
 		 477 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0480  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 488 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5247  EmrB/QacA family drug resistance transporter  43.17 
 
 		 475 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237506  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5000  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.7 
 
 		 475 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0009  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000535821  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4207  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0009  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 474 aa  341  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000216435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4951  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.92 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4824  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.92 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0486949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0414  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 473 aa  329  7e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.444257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0514  EmrB/QacA family drug resistance transporter  44.18 
 
 		 475 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507983  normal  0.797447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4769  major facilitator transporter  43.47 
 
 		 470 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0407  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  44.77 
 
 		 462 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1079  major facilitator superfamily multi-drug efflux pump  39.91 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0013428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1145  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.44 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1382  EmrB/QacA family drug resistance transporter  39.46 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.229793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4805  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.675346  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0774  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 		 469 aa  308  9e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>