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for query gene Hoch_4414 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 503 aa  971    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.97 
 
 		 534 aa  246  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.23 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2424  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.55 
 
 		 496 aa  210  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.153591 
 
 
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NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  29.96 
 
 		 490 aa  209  7e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.08 
 
 		 635 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
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NC_013385  Adeg_0100  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.69 
 
 		 524 aa  206  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.04 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.13 
 
 		 541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2448  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.03 
 
 		 570 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.6 
 
 		 515 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.87 
 
 		 514 aa  200  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0268  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.2 
 
 		 500 aa  200  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0312698  decreased coverage  0.00157172 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1833  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.93 
 
 		 564 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0281974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06270  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.67 
 
 		 514 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_012669  Bcav_0845  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.72 
 
 		 489 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222515  normal  0.167552 
 
 
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NC_008009  Acid345_1476  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.92 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1415  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 475 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00176967  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1972  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.4 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.073103  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_2675  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.82 
 
 		 482 aa  193  5e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.87 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22510  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.25 
 
 		 494 aa  192  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.319093  n/a   
 
 
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NC_009513  Lreu_1519  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.38 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.77 
 
 		 522 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 494 aa  189  8e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2937  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.21 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.486174  n/a   
 
 
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NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  28.51 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1326  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  31.25 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473052  normal  0.0275386 
 
 
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NC_002976  SERP1944  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.31 
 
 		 658 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3251  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.74 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2982  multidrug resistance protein B  28.5 
 
 		 492 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3230  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.04 
 
 		 492 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3232  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.27 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.74 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2014  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.27 
 
 		 513 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.89 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.65 
 
 		 558 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.89 
 
 		 504 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2994  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3223  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.27 
 
 		 492 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0356226  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2922  multidrug resistance protein B  28.27 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_3428  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.2 
 
 		 471 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4699  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.85 
 
 		 599 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_1298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.91 
 
 		 500 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000893352  hitchhiker  0.00471574 
 
 
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NC_010087  Bmul_5522  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 530 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4399  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 597 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00696651  n/a   
 
 
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NC_010557  BamMC406_6273  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 534 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146254 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2376  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.9 
 
 		 579 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2739  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000169232  n/a   
 
 
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NC_009632  SaurJH1_2422  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.73 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.845412  n/a   
 
 
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NC_013530  Xcel_3361  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 		 492 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_1875  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.4 
 
 		 527 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.994657 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6559  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.41 
 
 		 534 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.830295  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_0617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.31 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_2099  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.64 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.710397 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1880  major facilitator superfamily permease  27.9 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0561  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.09 
 
 		 599 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000151463  hitchhiker  0.00000000000000678179 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5403  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.05 
 
 		 537 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3194  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 		 484 aa  179  7e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.794509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4692  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.2 
 
 		 599 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2224  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 526 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.264069  normal  0.72348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1459  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.66 
 
 		 483 aa  179  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.257317  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0842  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3229  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.78 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.179546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4676  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.2 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00195609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4464  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.737474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4299  multidrug resistance protein B  29.44 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.649426  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4683  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  29.2 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.74665e-44 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4310  multidrug resistance protein B  28.95 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4812  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.95 
 
 		 599 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.127812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3614  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.63 
 
 		 554 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.315479  normal  0.0101645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 520 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1282  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 520 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6549  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.53 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.984668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1891  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.52 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05820  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.835158  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.1 
 
 		 537 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.04 
 
 		 520 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6155  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.29 
 
 		 530 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963451  normal  0.19124 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.5 
 
 		 508 aa  177  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 		 509 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.67 
 
 		 511 aa  176  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2489  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.78 
 
 		 657 aa  176  9e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 526 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal  1 
 
 
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NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.08 
 
 		 520 aa  176  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.82 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4486  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.64 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000152739  hitchhiker  0.000119733 
 
 
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NC_014165  Tbis_1314  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  33.02 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00952843  normal  0.308238 
 
 
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NC_010725  Mpop_1202  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.81 
 
 		 536 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00417242  normal  0.367186 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.88 
 
 		 512 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.02 
 
 		 646 aa  173  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.54 
 
 		 520 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_1642  drug:H+ antiporter-2 (DHA2) family protein  30.07 
 
 		 539 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0750127  n/a   
 
 
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