81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1056 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  94.29 
 
 		 420 aa  756    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  845    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  58.58 
 
 		 407 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  52.58 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  46.21 
 
 		 452 aa  329  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 403 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  41.33 
 
 		 431 aa  257  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  41.92 
 
 		 424 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  38.13 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 		 411 aa  230  3e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  38.71 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 439 aa  229  8e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  38.98 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  39.21 
 
 		 439 aa  226  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  39.42 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 425 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 438 aa  212  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  38.72 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  36.77 
 
 		 418 aa  207  4e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  38.46 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  34.79 
 
 		 419 aa  195  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  34 
 
 		 451 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  33.75 
 
 		 451 aa  193  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  34.58 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  36.63 
 
 		 420 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 453 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 426 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  36.46 
 
 		 415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 451 aa  182  7e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 420 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 422 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 420 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  31.81 
 
 		 439 aa  170  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  33.93 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 452 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.13 
 
 		 372 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  26.62 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10750  major facilitator superfamily MFS_1  21.64 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000151203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3301  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.58 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.970656 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 508 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  31.13 
 
 		 534 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1364  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0393169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 512 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 493 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.29 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 419 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 407 aa  43.5  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 392 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>