119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2953 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  83.98 
 
 		 419 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  817    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  83.97 
 
 		 419 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  98.08 
 
 		 417 aa  804    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  82.1 
 
 		 420 aa  624  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  84.02 
 
 		 419 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  84.02 
 
 		 419 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  84.02 
 
 		 419 aa  617  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  84.17 
 
 		 420 aa  614  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  84.75 
 
 		 419 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  84.96 
 
 		 419 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  84.48 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  84.48 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  84.48 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  84.48 
 
 		 415 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  83.05 
 
 		 422 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  82.97 
 
 		 420 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  81.82 
 
 		 372 aa  509  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  48.15 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 426 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  51.03 
 
 		 452 aa  354  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  51.62 
 
 		 451 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  48.76 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 416 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  50 
 
 		 446 aa  340  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  48.33 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  50.52 
 
 		 386 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 432 aa  240  4e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  36.7 
 
 		 417 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 439 aa  223  4e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 425 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 		 436 aa  216  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  34.44 
 
 		 418 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 420 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 439 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  34.51 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.95 
 
 		 411 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 433 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  35.25 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  34.35 
 
 		 419 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  34.66 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  35.95 
 
 		 407 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 452 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 426 aa  149  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  28.43 
 
 		 431 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 421 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 421 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 449 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  31.22 
 
 		 405 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 428 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  25.97 
 
 		 473 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.37 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.28 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.27 
 
 		 421 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  22.92 
 
 		 415 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 392 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 397 aa  50.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0860  MFS family nucleoside/H(+) symporter  23.91 
 
 		 395 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000354031  hitchhiker  0.0000116391 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  31.72 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26062  MFS family transporter: nitrate  23.66 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.177883  normal  0.675412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 392 aa  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  23.08 
 
 		 277 aa  46.6  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  29.8 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3953  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.690116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  28.37 
 
 		 401 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  24.2 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  24.18 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1567  major facilitator superfamily transporter  25.73 
 
 		 365 aa  44.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  21.46 
 
 		 957 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>