261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1558 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  100 
 
 		 438 aa  853    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  95.66 
 
 		 417 aa  658    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  98.8 
 
 		 417 aa  802    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  75.64 
 
 		 410 aa  526  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  72.73 
 
 		 411 aa  528  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  71.97 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  71.97 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 432 aa  241  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 424 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  37.87 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  38.16 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 425 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  37.25 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 439 aa  220  5e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 439 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 423 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 411 aa  206  9e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 438 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  41.64 
 
 		 421 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 434 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  40.06 
 
 		 419 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  33.5 
 
 		 418 aa  187  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  32.35 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  34.52 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  38.48 
 
 		 407 aa  179  9e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 451 aa  177  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 451 aa  177  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 419 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  30.81 
 
 		 420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  36.05 
 
 		 405 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 451 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 417 aa  150  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 417 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  30.77 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  31.04 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 426 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 416 aa  147  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 452 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  31.18 
 
 		 372 aa  117  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  22.06 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2577  major facilitator superfamily MFS_1  30.46 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363231  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 472 aa  57  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4424  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 495 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.133248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  22.49 
 
 		 496 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.08 
 
 		 394 aa  55.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1171  general substrate transporter  24.9 
 
 		 491 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0956509  normal  0.0980355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1159  general substrate transporter  24.9 
 
 		 493 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95972  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  23.72 
 
 		 454 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 407 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0894  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 453 aa  53.1  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 454 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 456 aa  53.1  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 454 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0483  inner membrane transport protein YajR  23.98 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0538  inner membrane transport protein YajR  23.98 
 
 		 454 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  25.72 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0800  general substrate transporter  24.51 
 
 		 452 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1281  general substrate transporter  24.31 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0545029  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  23.72 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  23.98 
 
 		 454 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  23.68 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4140  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.57 
 
 		 505 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6155  general substrate transporter  25.87 
 
 		 531 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2038  general substrate transporter  25.1 
 
 		 527 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2108  major facilitator superfamily transporter  31.08 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0152433  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3617  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.15 
 
 		 532 aa  51.6  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.23 
 
 		 409 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2793  proline/betaine transporter  24.31 
 
 		 626 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  29.32 
 
 		 548 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 388 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>