230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2467 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  100 
 
 		 417 aa  822    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  92.77 
 
 		 432 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  79.95 
 
 		 420 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  60.77 
 
 		 439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  60.53 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  59.41 
 
 		 425 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  61.95 
 
 		 438 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 424 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  61.42 
 
 		 411 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  57.63 
 
 		 424 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  59.26 
 
 		 442 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  61.06 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  55.94 
 
 		 418 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  58.15 
 
 		 420 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  63.27 
 
 		 421 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  61.75 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 451 aa  298  9e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 451 aa  297  2e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 		 453 aa  289  7e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 436 aa  276  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 446 aa  272  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 453 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  43.15 
 
 		 451 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 426 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  39.34 
 
 		 439 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 416 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 403 aa  243  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  40.51 
 
 		 433 aa  239  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 		 428 aa  238  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 421 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 		 420 aa  233  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 421 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  35.01 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  36.7 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  40.33 
 
 		 407 aa  229  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 417 aa  229  9e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 410 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 419 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  35.78 
 
 		 420 aa  221  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 419 aa  216  7e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  36.1 
 
 		 420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 411 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 452 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  36.73 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  36.78 
 
 		 422 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 420 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 449 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  38.34 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 438 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  38.82 
 
 		 405 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.46 
 
 		 372 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  29.61 
 
 		 473 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  26.73 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  26.73 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.69 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  26.42 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  25.79 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.42 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  26.42 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  26.1 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.3 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  25.47 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 442 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  25.52 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 408 aa  57  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  19.84 
 
 		 388 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2283  major facilitator superfamily MFS_1  19.47 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.446787  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1990  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.58 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.648809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  24.09 
 
 		 409 aa  54.3  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.13 
 
 		 488 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 411 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1258  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.83 
 
 		 485 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.11 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  29.08 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.83 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7319  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  27.86 
 
 		 517 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1810  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 491 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174923  hitchhiker  0.00284389 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06739  multidrug resistance protein D  29.41 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  28.89 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4100  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.71 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256573 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  23.99 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>