83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6392 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  100 
 
 		 452 aa  887    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 420 aa  332  8e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  46.79 
 
 		 428 aa  332  9e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  50.81 
 
 		 407 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 421 aa  307  3e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 421 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 403 aa  259  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  35.96 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 424 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  34.83 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 439 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 442 aa  210  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 420 aa  206  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  34.16 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  36.22 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 439 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 424 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 434 aa  193  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  36.02 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 451 aa  183  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 451 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 453 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  32.34 
 
 		 436 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 438 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  30.96 
 
 		 439 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 		 453 aa  156  9e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 419 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  32.57 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 386 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 417 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 419 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  30.6 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 420 aa  146  6e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 420 aa  142  8e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 433 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  30.25 
 
 		 422 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  30.14 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  28.92 
 
 		 372 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  21.45 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  27.83 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  22.44 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4932  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1556  major facilitator transporter  25.71 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.897116  normal  0.129024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1542  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  27.42 
 
 		 394 aa  45.1  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3149  hypothetical protein  23.59 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 407 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  25.42 
 
 		 1833 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 388 aa  43.5  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 410 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  27.23 
 
 		 409 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>