103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6731 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  799    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  100 
 
 		 421 aa  799    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  99.05 
 
 		 421 aa  790    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  52.58 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  52.83 
 
 		 420 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  56.32 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  46.25 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  46.23 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  43.95 
 
 		 411 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 424 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  40.8 
 
 		 417 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 423 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 439 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 439 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 420 aa  226  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 424 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  36.7 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 420 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  39.05 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  36.79 
 
 		 436 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 451 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  39.42 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  36.84 
 
 		 411 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  36.54 
 
 		 410 aa  172  9e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 451 aa  169  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  33.76 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 438 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  37.72 
 
 		 417 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 417 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 453 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 386 aa  159  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 449 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  31.9 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  31.88 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 419 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 420 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  32.22 
 
 		 420 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  31.09 
 
 		 419 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  32.04 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 420 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  26.05 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  27.87 
 
 		 372 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  32.67 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2755  major facilitator superfamily MFS_1  22.5 
 
 		 392 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1699  multidrug resistance protein B  33.06 
 
 		 404 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1139  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1716  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 410 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354748  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4960  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.877021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3483  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1258  MFS family nucleoside/H(+) symporter  28.85 
 
 		 422 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4239  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 493 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4127  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.648562  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0976  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 387 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3392  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.48 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.661215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1859  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.757692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1896  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1943  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1722  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.636951  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1674  multidrug resistance protein B  32.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1858  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.817955  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2158  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 389 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1455  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4465  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0456997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0488  putative permease  29.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.453085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1974  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1908  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.79 
 
 		 509 aa  45.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4932  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0872  major facilitator superfamily MFS_1  23.02 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.69388  normal  0.678306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0658  major facilitator superfamily drug efflux transporter  29.8 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 393 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2238  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  31.3 
 
 		 507 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.382837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2256  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.3 
 
 		 507 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0484017  normal  0.408162 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>