163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2714 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  94.04 
 
 		 438 aa  739    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  98.86 
 
 		 439 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  863    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  79.86 
 
 		 434 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  74.59 
 
 		 439 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  75.17 
 
 		 442 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  71.5 
 
 		 420 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  59.72 
 
 		 432 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  60.77 
 
 		 417 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  60.78 
 
 		 425 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  61.92 
 
 		 424 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  62.34 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  59.14 
 
 		 420 aa  420  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  55.64 
 
 		 418 aa  414  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  64.44 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  55.82 
 
 		 424 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  60.53 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 423 aa  317  3e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  42.65 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 451 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 451 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  38.97 
 
 		 453 aa  273  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  38.76 
 
 		 439 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  39.55 
 
 		 451 aa  251  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  40 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 426 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  36.23 
 
 		 416 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  40.53 
 
 		 433 aa  238  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 421 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 421 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 420 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  37.53 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  41.18 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  34.75 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 410 aa  202  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 419 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 438 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 419 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  33.67 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 449 aa  190  4e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  32.37 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  33.17 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 415 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 422 aa  183  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  34.39 
 
 		 405 aa  169  7e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  29.6 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  31.54 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.19 
 
 		 388 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07936  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01520)  23.53 
 
 		 504 aa  55.1  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1358  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 489 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.5787  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3267  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.309977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.77 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2046  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.838973  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5357  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 497 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.987143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2347  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.87 
 
 		 495 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0698693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1647  hypothetical protein  31.53 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.411737  normal  0.910118 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 478 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0160  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 		 496 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0154454 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1252  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  28.26 
 
 		 517 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 478 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 490 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.35 
 
 		 484 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.54 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0685  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  24.65 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0318  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.24 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0550  tRNA-guanine transglycosylase, various specificities  28.12 
 
 		 1062 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.23 
 
 		 504 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  21.11 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 511 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 486 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1166  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2286  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.19 
 
 		 495 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.349328  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>