More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2576 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  809    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  28.78 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  27.93 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 405 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4092  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 		 396 aa  111  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  25.74 
 
 		 384 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  26.94 
 
 		 388 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 411 aa  94  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  24.62 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 407 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1678  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 474 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  24.55 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  24.93 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  24.55 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  25.45 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  25.45 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.4 
 
 		 425 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1560  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.53 
 
 		 401 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1851  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  25.52 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3844  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.50058  normal  0.461173 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 478 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  29.56 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  34 
 
 		 539 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.65 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  37.59 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  27.65 
 
 		 478 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.59 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.59 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.59 
 
 		 469 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4845  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  37.59 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000942514  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.59 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0270  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 497 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2019  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.57 
 
 		 401 aa  70.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.11668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  33.58 
 
 		 410 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1602  major facilitator superfamily MFS_1  33.16 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.822516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1911  bicyclomycin/multidrug efflux system  24.3 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1308  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000644714  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  26.27 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0668  major facilitator transporter  30.19 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.22 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4760  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.57 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21760  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  22.19 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2792  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.9 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2717  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.9 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0392308  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1491  bicyclomycin/multidrug efflux system  25.9 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.646257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 381 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.69 
 
 		 480 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3888  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 394 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0648184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2281  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.65 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000081602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  33.64 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1730  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3710  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.17 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1284  major facilitator superfamily transporter  30.91 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0537207  normal  0.575003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  33.63 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.98 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0751  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3767  major facilitator superfamily MFS_1  27.24 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.952675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4433  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.944293  normal  0.4083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3850  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.330919  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0048  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.848234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3322  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  27.6 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4110  multidrug translocase MdfA  26.27 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2558  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.34 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  26.64 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1015  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.67 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  32.74 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3760  multidrug translocase  26.27 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  32.74 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1801  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.89 
 
 		 504 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0797811  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2425  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.46 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 395 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  29.58 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2379  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  23.46 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0966987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>