More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4446 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  819    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  83.45 
 
 		 449 aa  615  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  75.19 
 
 		 410 aa  527  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  71.83 
 
 		 411 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  70.38 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  70.13 
 
 		 417 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  70.15 
 
 		 417 aa  476  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 424 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  36.89 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 425 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  37.47 
 
 		 420 aa  227  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 424 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 439 aa  222  9e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 420 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 442 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 434 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 411 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 		 420 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 		 421 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  39.26 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  34.29 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 453 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  37.23 
 
 		 407 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 419 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 452 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  31.08 
 
 		 419 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 		 453 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  31.1 
 
 		 419 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  29.62 
 
 		 431 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 446 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  30.95 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  32.53 
 
 		 420 aa  152  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 451 aa  151  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 416 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 417 aa  147  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  30.93 
 
 		 439 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 422 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  32.53 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 386 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  34.47 
 
 		 405 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  30.97 
 
 		 372 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  23.7 
 
 		 473 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 414 aa  67  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0543  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily protein  33.82 
 
 		 400 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00469398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.13 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.34 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0457  major facilitator superfamily permease  27.38 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000209922  normal  0.207287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25 
 
 		 541 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  26.87 
 
 		 458 aa  56.6  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  28.74 
 
 		 504 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3022  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.358015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 516 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 524 aa  55.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03040  putative MFS transporter  32.32 
 
 		 501 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.479989  hitchhiker  0.0000743098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0331  MFS family transporter  32.32 
 
 		 515 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.21 
 
 		 394 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3494  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  31.62 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.61895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 524 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3956  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  32.28 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4515  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.66 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.5 
 
 		 491 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539583  hitchhiker  0.00153857 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3381  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 466 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1502  major facilitator family protein  26.83 
 
 		 465 aa  53.5  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0297  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  29.41 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.169159  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1292  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.674052  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.32 
 
 		 538 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  26.06 
 
 		 478 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  26.06 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>