124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2304 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  97.61 
 
 
419 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  87.5 
 
 
420 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  84.02 
 
 
417 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  95.47 
 
 
419 aa  727    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  97.14 
 
 
420 aa  731    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  100 
 
 
419 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  95.23 
 
 
419 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  83.65 
 
 
419 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  87.71 
 
 
415 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  87.71 
 
 
415 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  87.71 
 
 
415 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  86.22 
 
 
422 aa  631  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  87.71 
 
 
415 aa  631  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  83.54 
 
 
417 aa  632  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  85.68 
 
 
420 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  84.91 
 
 
372 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  52.84 
 
 
426 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  49.25 
 
 
451 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 
451 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  48.64 
 
 
453 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  50 
 
 
416 aa  362  8e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  51.89 
 
 
439 aa  360  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  49.87 
 
 
451 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  48.5 
 
 
446 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  50.13 
 
 
452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  48.27 
 
 
453 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  51.72 
 
 
386 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  36.25 
 
 
432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  34.9 
 
 
417 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 
436 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  34.45 
 
 
423 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  35.43 
 
 
420 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  35.5 
 
 
425 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  35.8 
 
 
439 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  36.01 
 
 
424 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  35.56 
 
 
424 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  35.68 
 
 
418 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  33.41 
 
 
439 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 
439 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  35.04 
 
 
434 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  34.52 
 
 
411 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  36.15 
 
 
433 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  33.33 
 
 
420 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 
428 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 
442 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 
420 aa  190  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  32.4 
 
 
403 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 
421 aa  170  5e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  33.7 
 
 
419 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  28.72 
 
 
431 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  35.29 
 
 
407 aa  159  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  31.13 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  29.32 
 
 
452 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
417 aa  150  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  28.39 
 
 
426 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
417 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  29.92 
 
 
410 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 
428 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  31.54 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  31.93 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  31.93 
 
 
421 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  31.87 
 
 
449 aa  140  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  30.05 
 
 
405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  23.91 
 
 
473 aa  113  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  28.64 
 
 
406 aa  62  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.63 
 
 
428 aa  55.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  33.81 
 
 
421 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  31.29 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2302  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  30.43 
 
 
412 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 
392 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
407 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  31.43 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  20.67 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  21.82 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08760  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13880)  29.69 
 
 
542 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194765  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51430  Proton/sugar symporter  24.19 
 
 
437 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  32.59 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2694  putative 3-phenylpropionic acid transporter  25.8 
 
 
396 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  29.66 
 
 
401 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.87 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362761  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  33.07 
 
 
426 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0740  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 
615 aa  45.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000446229  decreased coverage  0.00171071 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.28 
 
 
539 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 
425 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49971  predicted protein  22.12 
 
 
957 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  26.22 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0241  major facilitator transporter  31.41 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0091  hypothetical protein  26.89 
 
 
277 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  28.99 
 
 
408 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>