109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6055 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 436 aa  860    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 439 aa  311  2e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  44.47 
 
 		 439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 424 aa  305  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 432 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 420 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 425 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  41.67 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 442 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 		 411 aa  294  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  45.16 
 
 		 424 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  43.8 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  43.24 
 
 		 438 aa  285  8e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  40.57 
 
 		 423 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 421 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  41.43 
 
 		 420 aa  262  6.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 426 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  46.26 
 
 		 419 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  38.35 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  38.96 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 		 453 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 419 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  36.45 
 
 		 453 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  35.05 
 
 		 439 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  36.67 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  37.14 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 419 aa  226  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 417 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  35.89 
 
 		 451 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  40 
 
 		 403 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 420 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  36.34 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  37.75 
 
 		 421 aa  209  9e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 421 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 421 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  36.43 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 422 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  34.31 
 
 		 426 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  33.57 
 
 		 431 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  38.11 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  35.17 
 
 		 433 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  34.65 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 411 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  34.45 
 
 		 372 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  28.57 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 449 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 428 aa  149  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 		 488 aa  57  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 		 388 aa  55.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0312  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1089  multidrug resistance transporter, Bcr family  24.87 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2294  major facilitator family transporter  27.91 
 
 		 458 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.843575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1833  multidrug efflux transport protein EefD  28.06 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.531383  hitchhiker  0.0000436585 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1930  multidrug efflux transport protein EefD  28.06 
 
 		 387 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00624404 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0976  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.61 
 
 		 426 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0884  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 486 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0881  drug resistance translocator protein  27.18 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0515514  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 528 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5351  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 678 aa  47  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3588  Bcr/CflA family multidrug resistance transporter  27.1 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.226455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.97 
 
 		 528 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 478 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.38 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2184  major facilitator transporter  32.23 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.27 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.14 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  28.98 
 
 		 455 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  30.82 
 
 		 525 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.6 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  33.91 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0846  multidrug resistance transporter, Bcr family  25.64 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.687428  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.25 
 
 		 500 aa  44.7  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5125  protein of unknown function DUF894 DitE  24.48 
 
 		 542 aa  44.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3075  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 509 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.73 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4800  multidrug resistance protein D  25 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>