More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0591 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0591  major facilitator transporter  100 
 
 
427 aa  844    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.584321  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10048  putative transporter  73.82 
 
 
424 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1952  major facilitator superfamily MFS_1  59.23 
 
 
418 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  46.14 
 
 
425 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2160  major facilitator superfamily permease  43.13 
 
 
427 aa  335  7e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.797788 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0372  major facilitator superfamily MFS_1  44.64 
 
 
416 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.862207  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2622  major facilitator transporter  43.75 
 
 
411 aa  317  2e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2641  major facilitator transporter  40.58 
 
 
499 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0424  drug:proton antiporter  45.86 
 
 
407 aa  305  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1342  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 
401 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000002456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3460  major facilitator transporter  40.25 
 
 
421 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0454626  hitchhiker  0.00919031 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2812  hypothetical protein  41.52 
 
 
399 aa  285  9e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.287004  normal  0.40248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4902  major facilitator superfamily MFS_1  43.37 
 
 
414 aa  283  5.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0403357  normal  0.0378794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00357  drug:proton antiporter  40.86 
 
 
410 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.018305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2733  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
415 aa  279  8e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.862267  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3776  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 
412 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  40.57 
 
 
421 aa  278  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0472  major facilitator transporter  41.25 
 
 
401 aa  276  5e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.618831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4653  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
427 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.366185 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0309  drug:proton antiporter  38.66 
 
 
414 aa  269  8.999999999999999e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4386  major facilitator transporter  37.56 
 
 
411 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.291842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0691  major facilitator transporter  38.65 
 
 
428 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0279  major facilitator transporter  39.6 
 
 
418 aa  257  3e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2972  major facilitator transporter  35.99 
 
 
415 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5805  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  35.58 
 
 
419 aa  256  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4026  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 
416 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.557727  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0743  major facilitator transporter  39.6 
 
 
410 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5333  hypothetical protein  36.57 
 
 
415 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4311  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
432 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4201  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
432 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3705  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 
411 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224607  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0980  major facilitator transporter  37.68 
 
 
413 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05067  hypothetical protein  37.91 
 
 
424 aa  250  4e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61170  putative transmembrane protein  39.65 
 
 
403 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2418  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 
412 aa  249  7e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3228  hypothetical protein  38.06 
 
 
405 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5268  MFS family transporter  39.14 
 
 
403 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2940  major facilitator superfamily MFS_1  39.59 
 
 
422 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3450  major facilitator transporter  40.72 
 
 
418 aa  246  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4652  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4514  major facilitator transporter  39.95 
 
 
406 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4288  hypothetical protein  35.24 
 
 
433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3145  major facilitator superfamily MFS_1  35.15 
 
 
440 aa  244  3e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.985088  normal  0.131643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4646  major facilitator transporter  39.69 
 
 
409 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4656  hypothetical protein  36.15 
 
 
427 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4151  MFS permease  37.44 
 
 
410 aa  242  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0786  major facilitator transporter  39.95 
 
 
406 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1281  major facilitator superfamily transporter  39.36 
 
 
415 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2101  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
479 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0069  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 
406 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3284  major facilitator transporter  37.96 
 
 
403 aa  237  4e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4481  major facilitator transporter  37.05 
 
 
416 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.646656  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2818  hypothetical protein  36.77 
 
 
404 aa  236  7e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1420  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 
420 aa  236  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5278  hypothetical protein  36.07 
 
 
408 aa  236  8e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.306023  normal  0.251543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4894  hypothetical protein  39.02 
 
 
412 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0972  major facilitator transporter  38.11 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.619052  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1023  major facilitator transporter  38.11 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1206  major facilitator transporter  38.11 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208797  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3573  major facilitator transporter  36.17 
 
 
416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  36.12 
 
 
451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5006  major facilitator transporter  35.36 
 
 
416 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.641572  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2480  major facilitator transporter  36.52 
 
 
457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.553694 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1810  putative transporter  37.62 
 
 
412 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.923423  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5216  major facilitator transporter  37.02 
 
 
416 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3299  major facilitator transporter  37.02 
 
 
416 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.174226  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3371  major facilitator transporter  36.5 
 
 
413 aa  230  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5069  major facilitator transporter  37.02 
 
 
416 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2137  major facilitator transporter  40.48 
 
 
424 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3130  major facilitator superfamily MFS_1  40.15 
 
 
406 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1399  major facilitator transporter  37.29 
 
 
360 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41856  normal  0.33149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  33.64 
 
 
420 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0652  major facilitator transporter  36.47 
 
 
423 aa  226  8e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0291479  normal  0.182714 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49890  membrame protein  37.56 
 
 
454 aa  224  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4337  major facilitator transporter  34.28 
 
 
414 aa  223  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3653  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
397 aa  221  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.758953  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  38.27 
 
 
421 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0591  hypothetical protein  37.75 
 
 
416 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1211  major facilitator transporter  38.1 
 
 
429 aa  217  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463321  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  36.71 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  35.19 
 
 
403 aa  209  9e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2285  major facilitator superfamily transporter  35.86 
 
 
455 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00827549  hitchhiker  0.000379074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2102  major facilitator transporter  33.66 
 
 
427 aa  197  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0117925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1572  major facilitator transporter  32.47 
 
 
415 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.58248  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1046  major facilitator transporter  33.03 
 
 
437 aa  196  8.000000000000001e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340511  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2647  major facilitator transporter  31.38 
 
 
524 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0098  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
428 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  31.29 
 
 
415 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 
445 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0830  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
422 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0559019  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2780  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
423 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.018642 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 
412 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  29.45 
 
 
474 aa  123  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1007  hypothetical protein  28.46 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.767675  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  27.2 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.16 
 
 
424 aa  120  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1388  hypothetical protein  27.65 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
432 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  28.26 
 
 
447 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>