99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2785 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  100 
 
 		 439 aa  860    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  73.33 
 
 		 426 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  72.66 
 
 		 416 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  73.4 
 
 		 386 aa  481  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  50.23 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  50.45 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  52.68 
 
 		 453 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  52.56 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 453 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  52 
 
 		 451 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  51.6 
 
 		 419 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 419 aa  345  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  49.38 
 
 		 417 aa  339  7e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  52.51 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  52.51 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  52.51 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  52.51 
 
 		 420 aa  333  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  50.63 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  50.5 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  50 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  50.5 
 
 		 415 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  50.51 
 
 		 420 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  42.51 
 
 		 452 aa  262  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  41.2 
 
 		 420 aa  259  6e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  41.89 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 425 aa  253  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 439 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  48.45 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  41.65 
 
 		 442 aa  248  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  39.34 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  40.92 
 
 		 424 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  38.07 
 
 		 418 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 411 aa  227  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 420 aa  226  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  37.74 
 
 		 419 aa  193  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 420 aa  171  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 426 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  31.81 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  34.55 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  31 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  30.99 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  30.1 
 
 		 431 aa  151  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  32.05 
 
 		 405 aa  120  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  30.18 
 
 		 417 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  24.89 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  26.81 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  27.6 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  30.71 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  26.88 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  29.92 
 
 		 464 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  25.12 
 
 		 411 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 390 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 464 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  25.12 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  27.32 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 411 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000109307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5050  general substrate transporter  28.36 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243206 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 426 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.26 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4519  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.301476  normal  0.140313 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 425 aa  45.8  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3215  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 494 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 406 aa  44.7  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 412 aa  44.3  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 428 aa  43.9  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0871  drug resistance transporter, Bcr/CflA subfamily  28.46 
 
 		 404 aa  43.5  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>