More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4410 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
419 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  93.67 
 
 
419 aa  636    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  93.67 
 
 
419 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  60.59 
 
 
416 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  40.55 
 
 
450 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  40 
 
 
412 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  41.37 
 
 
407 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 
445 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  39.95 
 
 
450 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  38.16 
 
 
398 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 
433 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  32.23 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  35.32 
 
 
413 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
410 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
471 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  29.57 
 
 
404 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
419 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.55 
 
 
424 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  27.6 
 
 
423 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  28.41 
 
 
424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
412 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  28.09 
 
 
423 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.93 
 
 
423 aa  126  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.49 
 
 
423 aa  126  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 
420 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.72 
 
 
424 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  29.81 
 
 
395 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.7 
 
 
423 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
423 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.54 
 
 
423 aa  124  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
423 aa  124  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.54 
 
 
423 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.6 
 
 
402 aa  123  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
396 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.3 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.36 
 
 
424 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
418 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
418 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
421 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
435 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  31.05 
 
 
405 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  26.39 
 
 
418 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  26.39 
 
 
418 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.73 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  26.67 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  26.11 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  31.02 
 
 
428 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  26.11 
 
 
418 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  26.11 
 
 
418 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.67 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.17 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.45 
 
 
412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
412 aa  110  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 
426 aa  106  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
422 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
407 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.31 
 
 
404 aa  103  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  23.5 
 
 
397 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  23.5 
 
 
397 aa  103  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  26.84 
 
 
416 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.39 
 
 
412 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.25 
 
 
397 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.25 
 
 
397 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.25 
 
 
397 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.1 
 
 
393 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.1 
 
 
393 aa  101  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.25 
 
 
397 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
396 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.53 
 
 
412 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.5 
 
 
397 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 
423 aa  99.8  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.33 
 
 
397 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  23.3 
 
 
412 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.3 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.3 
 
 
412 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.93 
 
 
397 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.3 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.81 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  26.01 
 
 
393 aa  92  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  26.01 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  26.01 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.88 
 
 
417 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.68 
 
 
412 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.06 
 
 
434 aa  90.1  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.74 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  24.28 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  24.32 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  21.25 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  22.29 
 
 
412 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  21.78 
 
 
412 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  24.85 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25.86 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  23.62 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>