278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4649 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 426 aa  815    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  28.57 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  30.38 
 
 		 450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  27.03 
 
 		 424 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.34 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.34 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.62 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.72 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 396 aa  99.8  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 445 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  28.81 
 
 		 405 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 410 aa  94.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 416 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.76 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.76 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 397 aa  90.1  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.51 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.51 
 
 		 397 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.51 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  25.51 
 
 		 397 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  25.25 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.51 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 399 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 398 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.02 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25.25 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.14 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  27.38 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  27.57 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  25.63 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.62 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  22.38 
 
 		 404 aa  76.3  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.44 
 
 		 413 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  24.45 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  25.92 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.92 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  23.33 
 
 		 418 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  22.35 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 452 aa  66.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  18.93 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  23.51 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  27.7 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  19.25 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  25.09 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  19.64 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.19 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  20.71 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  18.68 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  18.68 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  19.5 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>