More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0401 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  84.22 
 
 
450 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  100 
 
 
450 aa  880    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 
433 aa  317  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  40.59 
 
 
445 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  41.27 
 
 
419 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  41.69 
 
 
416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  39.04 
 
 
407 aa  244  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  40.85 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  38.13 
 
 
412 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  40.85 
 
 
419 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  41.46 
 
 
410 aa  229  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  38.46 
 
 
398 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  36.48 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  30.31 
 
 
432 aa  189  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
471 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 
419 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
405 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  28.99 
 
 
424 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  27.55 
 
 
423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  31.25 
 
 
423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
423 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.04 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.04 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.04 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.04 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  30.75 
 
 
395 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.51 
 
 
424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 
401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.21 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.52 
 
 
423 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.95 
 
 
423 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 
422 aa  123  8e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
420 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.51 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 
426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
415 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.21 
 
 
424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  26.12 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  28.42 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.94 
 
 
428 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.32 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
435 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.85 
 
 
396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24.42 
 
 
412 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  27.97 
 
 
407 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  26.74 
 
 
393 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  30.23 
 
 
405 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  26.74 
 
 
393 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  26.41 
 
 
397 aa  97.4  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  26.74 
 
 
416 aa  96.7  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.92 
 
 
397 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.92 
 
 
397 aa  94  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.92 
 
 
397 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  25.67 
 
 
397 aa  92  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.67 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  24.26 
 
 
418 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.47 
 
 
381 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  29.55 
 
 
409 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
418 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.43 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  24.33 
 
 
418 aa  91.3  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.05 
 
 
418 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.43 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.04 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  25.43 
 
 
397 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  25.48 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  24.12 
 
 
418 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.82 
 
 
418 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 
417 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.73 
 
 
434 aa  89.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  30.72 
 
 
452 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.82 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25.67 
 
 
397 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  25.07 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 
423 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.87 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
397 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
421 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.07 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.57 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.33 
 
 
412 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.74 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  23.7 
 
 
417 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.74 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.74 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  25.43 
 
 
417 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  25.2 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  25.39 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.69 
 
 
409 aa  80.5  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  24.45 
 
 
398 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  24.76 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  24.76 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  29.89 
 
 
1075 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  28.9 
 
 
419 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>