216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0785 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
412 aa  837    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  57.86 
 
 
422 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 
435 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.32 
 
 
398 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  24.86 
 
 
407 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.04 
 
 
412 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.46 
 
 
423 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.46 
 
 
423 aa  123  7e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.46 
 
 
423 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.46 
 
 
423 aa  123  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.88 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.52 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
426 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.04 
 
 
424 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.18 
 
 
423 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.01 
 
 
424 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  25 
 
 
413 aa  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
445 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  23.75 
 
 
416 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.22 
 
 
396 aa  107  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 
405 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 
419 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.48 
 
 
424 aa  102  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.12 
 
 
423 aa  102  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  23.01 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
471 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.42 
 
 
450 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.85 
 
 
404 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
410 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 
433 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.43 
 
 
424 aa  89.7  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.78 
 
 
450 aa  88.6  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.76 
 
 
405 aa  86.7  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.18 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  23.08 
 
 
432 aa  83.2  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 
485 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.82 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.38 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.98 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.47 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.47 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  21.76 
 
 
418 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.47 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.47 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.47 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.92 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.47 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.18 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  25.23 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.92 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.92 
 
 
412 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.01 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.01 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.04 
 
 
402 aa  68.9  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.01 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.33 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  19.81 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  19.09 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  23.8 
 
 
392 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  22.41 
 
 
395 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  21.7 
 
 
393 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  22.22 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.48 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  20.88 
 
 
452 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  23.73 
 
 
401 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  22.53 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  22.73 
 
 
393 aa  62.4  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.15 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  22.73 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  22.48 
 
 
397 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  22.83 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  22.73 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  20.45 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  22.26 
 
 
414 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  21.2 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  23.17 
 
 
406 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  20.45 
 
 
412 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20.19 
 
 
412 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  21.83 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.32 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  22.67 
 
 
416 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  22.72 
 
 
434 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  22.44 
 
 
393 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  22.15 
 
 
404 aa  57  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  22.98 
 
 
426 aa  56.6  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  22.83 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  22.83 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  22.83 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 
407 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  22.83 
 
 
402 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.742422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>