More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1474 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1474  putative permease  100 
 
 
432 aa  858    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 
419 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  33.77 
 
 
398 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  30.31 
 
 
450 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  31.07 
 
 
407 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  31.35 
 
 
412 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  32.67 
 
 
419 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  31.86 
 
 
450 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
445 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
419 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  29.3 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  30.02 
 
 
410 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 
433 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  31.16 
 
 
413 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.08 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 
471 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 
405 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.2 
 
 
424 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.32 
 
 
423 aa  106  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 
419 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.6 
 
 
395 aa  99.8  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
422 aa  99.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
428 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
435 aa  97.1  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.64 
 
 
424 aa  97.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
397 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  24.39 
 
 
401 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 
415 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
399 aa  94  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.87 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.62 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.35 
 
 
424 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
412 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.88 
 
 
396 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.62 
 
 
423 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.62 
 
 
402 aa  89.4  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.75 
 
 
424 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.24 
 
 
423 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.99 
 
 
423 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26.49 
 
 
414 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  23.98 
 
 
400 aa  84  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 
417 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  26.97 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.56 
 
 
423 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  26.12 
 
 
397 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  24.44 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.8 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.8 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.94 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.94 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 
420 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  26.12 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  26.12 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  26.12 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.68 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  23.12 
 
 
418 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.66 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.2 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  23.34 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.76 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.87 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.87 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.75 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.86 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.94 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  26.12 
 
 
397 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  24.7 
 
 
393 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.65 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  26.12 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  24.7 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  24.7 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  26.62 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7272  major facilitator transporter  26.42 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.93 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  25.4 
 
 
417 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.95 
 
 
412 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  20.79 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  26.3 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.45 
 
 
434 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  22.25 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  28.49 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.91 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  20.16 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.85 
 
 
398 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  20.16 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1174  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 
409 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148034  normal  0.0846365 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  22.37 
 
 
393 aa  67  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  25 
 
 
442 aa  67  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.64 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.64 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  21.04 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  24.77 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  22.28 
 
 
395 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.73 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>