100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2014 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
410 aa  819    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  40.35 
 
 
401 aa  286  7e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  35.54 
 
 
398 aa  250  4e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  32.83 
 
 
438 aa  205  9e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  30.56 
 
 
397 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  29.5 
 
 
416 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  31.95 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  31.71 
 
 
397 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  31.71 
 
 
397 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  31.71 
 
 
397 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  31.71 
 
 
397 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  31.71 
 
 
397 aa  187  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  31.46 
 
 
397 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  31.46 
 
 
397 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  30.88 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  29.73 
 
 
397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
399 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  31.78 
 
 
397 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  30.55 
 
 
404 aa  179  9e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  31.02 
 
 
393 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  31.02 
 
 
393 aa  176  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 
397 aa  176  9e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 
407 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.13 
 
 
450 aa  79  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.08 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.27 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.27 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.27 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.27 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  20.23 
 
 
423 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  20.23 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.45 
 
 
423 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  20.98 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  21.14 
 
 
424 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  24.59 
 
 
398 aa  68.9  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.75 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.27 
 
 
445 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.28 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.28 
 
 
412 aa  67  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
426 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.33 
 
 
450 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  20.57 
 
 
419 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.37 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.88 
 
 
409 aa  60.8  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  21.93 
 
 
421 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.04 
 
 
423 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  22.54 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  20.59 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  21.75 
 
 
412 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  23.08 
 
 
427 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  22.5 
 
 
389 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.19 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  31.78 
 
 
1833 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.25 
 
 
413 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.25 
 
 
404 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  20.8 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  22.77 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  19.16 
 
 
432 aa  50.8  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.28 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.02 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  20.11 
 
 
424 aa  50.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  22.62 
 
 
395 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  22.97 
 
 
460 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 
404 aa  48.5  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  25 
 
 
364 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  22.69 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  22.97 
 
 
464 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  22.75 
 
 
460 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 
452 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  22.97 
 
 
464 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  20.77 
 
 
442 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  21.31 
 
 
409 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  24.24 
 
 
423 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  21.58 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  21.81 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  25.36 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  22.76 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.53 
 
 
485 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 
390 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  24.46 
 
 
426 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  25.91 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  25 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  39.34 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
401 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 
398 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  22.93 
 
 
370 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  24.53 
 
 
418 aa  44.3  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2905  hypothetical protein  36.36 
 
 
121 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0145111  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  23.04 
 
 
398 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  22.45 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.53 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  28.91 
 
 
415 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.53 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.71 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.71 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  21.72 
 
 
412 aa  43.1  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  22.25 
 
 
416 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3885  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
403 aa  42.7  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.37466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>