198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1664 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 428 aa  810    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 398 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  32.79 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 419 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.68 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 450 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 419 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  29.06 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 450 aa  104  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  29.14 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 404 aa  102  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 395 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 413 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 405 aa  93.6  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 		 399 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.48 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 471 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 		 412 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 433 aa  87  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  23.88 
 
 		 419 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.55 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.52 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.99 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.16 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.94 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  21.67 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.94 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.16 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.94 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.16 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.94 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.94 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  24.16 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.71 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.31 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  21.98 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  21.98 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  21.98 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  21.98 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  20.8 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25.45 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  20.97 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.16 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.15 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  21.24 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23.94 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 381 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  20.62 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  21.47 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.45 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  22.71 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1618  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.4 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.3 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  22.66 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  27.07 
 
 		 395 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  27.07 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  27.07 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  27.07 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  27.07 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  26.75 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 402 aa  54.7  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  23.98 
 
 		 395 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.48 
 
 		 423 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  29.78 
 
 		 409 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 393 aa  53.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  26.78 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>