106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3966 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  100 
 
 		 1075 aa  2047    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  50.96 
 
 		 433 aa  342  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  30.39 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  30.79 
 
 		 433 aa  97.8  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 450 aa  96.3  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 450 aa  91.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  27.2 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  30.16 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 381 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 419 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.22 
 
 		 405 aa  67  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 419 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 419 aa  66.2  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1180  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.98 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.98 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 452 aa  63.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.98 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 399 aa  60.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 393 aa  60.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 393 aa  60.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 412 aa  60.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  22.96 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.02 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.54 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.16 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.41 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  22.96 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  23.41 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  23.41 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  23.81 
 
 		 397 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  23.41 
 
 		 397 aa  57.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  23.81 
 
 		 397 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  23.41 
 
 		 397 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.51 
 
 		 397 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.89 
 
 		 397 aa  56.2  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 410 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 418 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 418 aa  55.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 404 aa  55.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 421 aa  56.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  20.46 
 
 		 404 aa  55.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.18 
 
 		 412 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23.41 
 
 		 397 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 423 aa  54.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.25 
 
 		 423 aa  54.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 423 aa  54.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 392 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 417 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 423 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 418 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 392 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 424 aa  52.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 420 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.77 
 
 		 409 aa  52.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  25.2 
 
 		 427 aa  52.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23 
 
 		 393 aa  52.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23 
 
 		 393 aa  52.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 412 aa  52.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 393 aa  51.6  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 417 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4246  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 415 aa  51.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000179551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  38.69 
 
 		 441 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  21.5 
 
 		 423 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.63 
 
 		 416 aa  50.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  22.13 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 518 aa  49.3  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  22.4 
 
 		 397 aa  49.7  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 423 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.56 
 
 		 424 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 397 aa  48.1  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4751  major facilitator superfamily protein  26.67 
 
 		 421 aa  47.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.092373  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  32.03 
 
 		 388 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  32.03 
 
 		 388 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  22.76 
 
 		 423 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 414 aa  47.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3638  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 409 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0205021  decreased coverage  0.00774423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  28.3 
 
 		 421 aa  46.6  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 433 aa  47  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  24.25 
 
 		 395 aa  47.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  28.29 
 
 		 414 aa  46.6  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2350  major facilitator transporter  36.56 
 
 		 420 aa  46.2  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.497178  normal  0.0402385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  24.25 
 
 		 395 aa  46.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  24.25 
 
 		 395 aa  46.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  28.57 
 
 		 423 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 423 aa  46.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 406 aa  45.8  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 428 aa  45.8  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  24.25 
 
 		 395 aa  45.8  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2674  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 443 aa  45.8  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 400 aa  45.8  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>