154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4024 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  99.74 
 
 		 392 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  793    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  94.88 
 
 		 392 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  42.16 
 
 		 393 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  40.8 
 
 		 381 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  34.61 
 
 		 405 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  35.44 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  32.22 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  32.22 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  32.22 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  31.75 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  32.97 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  32.97 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  32.7 
 
 		 395 aa  176  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  32.7 
 
 		 395 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  32.78 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  32.7 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  32.7 
 
 		 395 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  32.34 
 
 		 395 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  31.59 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  27 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  28.53 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.21 
 
 		 412 aa  130  6e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  26.21 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  26.55 
 
 		 412 aa  126  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.36 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 426 aa  123  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 432 aa  116  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  26.03 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  30.75 
 
 		 409 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  24.34 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.56 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.56 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.56 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.56 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.55 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.87 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.74 
 
 		 423 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 424 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.24 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 424 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 395 aa  93.2  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25 
 
 		 423 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 416 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  21.95 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  25 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.25 
 
 		 409 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  26.99 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  20.1 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  25.15 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.07 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  30 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  20.52 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  19.19 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  21.08 
 
 		 393 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  19.23 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  20.23 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  19.23 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  20.23 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.14 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  20.23 
 
 		 393 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.12 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  19.12 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  20.69 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  19.65 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  19.65 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  20.3 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  19.94 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  19.53 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  19.65 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 364 aa  50.8  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2602  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4237  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>