157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01504 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  100 
 
 
395 aa  782    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  99.24 
 
 
395 aa  776    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  100 
 
 
395 aa  782    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  99.75 
 
 
395 aa  781    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  99.24 
 
 
395 aa  776    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  96.96 
 
 
395 aa  738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  99.49 
 
 
395 aa  780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  97.97 
 
 
395 aa  747    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  77.47 
 
 
395 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  77.47 
 
 
395 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  77.47 
 
 
395 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 
395 aa  585  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  68.88 
 
 
397 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  38.95 
 
 
393 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  38.68 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  38.68 
 
 
393 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  40.11 
 
 
407 aa  257  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  31.75 
 
 
381 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  33.24 
 
 
392 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  32.97 
 
 
404 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  32.97 
 
 
392 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  29.49 
 
 
406 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28 
 
 
395 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.3 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.9 
 
 
423 aa  113  6e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27.37 
 
 
405 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.05 
 
 
434 aa  98.6  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
423 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.46 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.25 
 
 
424 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.46 
 
 
423 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.73 
 
 
413 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.69 
 
 
416 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.8 
 
 
412 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.78 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.8 
 
 
412 aa  87  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.33 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.34 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.87 
 
 
412 aa  82.8  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.56 
 
 
424 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  22.25 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.46 
 
 
423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.02 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  22.53 
 
 
417 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  24.1 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  23.18 
 
 
426 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  22.02 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  23.6 
 
 
412 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
423 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  22.94 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  23.46 
 
 
412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  23.14 
 
 
432 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  22.96 
 
 
464 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  22.94 
 
 
460 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  22.93 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.36 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  21.86 
 
 
450 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.19 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.19 
 
 
412 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  23.72 
 
 
412 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  27.15 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  27.15 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
391 aa  61.2  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 
392 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  21.49 
 
 
450 aa  59.7  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.02 
 
 
421 aa  59.3  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.19 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  22.32 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  22.87 
 
 
412 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  23.05 
 
 
404 aa  56.2  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  22.32 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.31 
 
 
418 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  21.85 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  21.51 
 
 
419 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  19.94 
 
 
407 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  19.83 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  24.25 
 
 
396 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.74 
 
 
409 aa  52.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.28 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  20.91 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  20.85 
 
 
418 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 
410 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
408 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
406 aa  51.2  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.54 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.09 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.54 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 
406 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
464 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  30 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.16 
 
 
418 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>