101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0417 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  100 
 
 		 364 aa  699    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 376 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  40.7 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2587  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 382 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 423 aa  93.6  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  25.27 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.81 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.81 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.81 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.81 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.81 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 393 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.51 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  25.51 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  25.51 
 
 		 397 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.6 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.25 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  20.87 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25.51 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.02 
 
 		 418 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 393 aa  54.3  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  25.29 
 
 		 418 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.03 
 
 		 424 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 418 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 404 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  25.16 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  27.73 
 
 		 402 aa  52.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  25.29 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 419 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 424 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.58 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  24.7 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 398 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.85 
 
 		 423 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 383 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  22.5 
 
 		 407 aa  49.7  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 414 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  23.53 
 
 		 406 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  24.16 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.22 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.22 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  25 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 450 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.39 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  25.16 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 391 aa  47  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  21.89 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.48 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.92 
 
 		 450 aa  46.6  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.29 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4929  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 464 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  21.68 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  24.24 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0753  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 432 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.22 
 
 		 398 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.92 
 
 		 423 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1263  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1278  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.742422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1234  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2022  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2206  multidrug resistance protein MdtH  24.29 
 
 		 402 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.151391 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.13 
 
 		 393 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>