101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2339 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  100 
 
 		 413 aa  825    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  54.81 
 
 		 416 aa  454  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  54.81 
 
 		 416 aa  454  1e-127  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  36.89 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 416 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 418 aa  169  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  27.04 
 
 		 418 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 418 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  27.07 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  27.57 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  27.32 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  25.85 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  22.14 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  24.81 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.68 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.62 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.36 
 
 		 423 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.19 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.64 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.39 
 
 		 423 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  20.44 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.71 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.88 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.68 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.31 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.87 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  23.69 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  21.04 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  22.34 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  22.81 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  21.04 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  22.34 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  19.6 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06064  hypothetical protein  21.9 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  21.61 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.41 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  22.82 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  22.28 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  22.82 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  22.28 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  22.28 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  20.83 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  22.54 
 
 		 397 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 381 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.48 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  22.54 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  20.85 
 
 		 395 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  21.87 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  21.59 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  25.98 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  21.1 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  22.94 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  20.77 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  19.05 
 
 		 398 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23 
 
 		 393 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  23.16 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  21.23 
 
 		 438 aa  49.3  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  20.83 
 
 		 426 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  17.51 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  20.71 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2685  major facilitator superfamily MFS_1  21.21 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.188987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 433 aa  46.6  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  22.76 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2943  major facilitator superfamily MFS_1  21.66 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  20.4 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  20.4 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  20.4 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  22.54 
 
 		 397 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  22.46 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  22.69 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  20.4 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  20.66 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  21.97 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  21.97 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  22.28 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>