181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2239 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  833    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3966  major facilitator transporter  50.96 
 
 
1075 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 
433 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  31.1 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  28.03 
 
 
433 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  29.89 
 
 
407 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.18 
 
 
397 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.18 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.18 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.94 
 
 
397 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.94 
 
 
397 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.69 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.54 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.44 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.69 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  26.57 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.69 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.27 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  22.27 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.27 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.27 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.45 
 
 
397 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.65 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.65 
 
 
393 aa  80.9  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  26.54 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1180  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.46 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  28.12 
 
 
404 aa  79  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.46 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  24.87 
 
 
407 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  27.49 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  27.49 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  29.6 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.08 
 
 
397 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  27.22 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  26.76 
 
 
395 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  30.58 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.34 
 
 
450 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.94 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.67 
 
 
395 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  27.05 
 
 
404 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.22 
 
 
423 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.94 
 
 
412 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.01 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.77 
 
 
423 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.16 
 
 
404 aa  69.3  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  27.49 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  21.39 
 
 
412 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  22.16 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  24.69 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  21.21 
 
 
413 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  21.94 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  24.69 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  24.69 
 
 
395 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 
399 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 
395 aa  67.4  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  26.24 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  24.93 
 
 
395 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  24.44 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  22.98 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  24.44 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  24.69 
 
 
395 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 
419 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  20.44 
 
 
424 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  22.41 
 
 
423 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.12 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3045  major facilitator transporter  27.6 
 
 
410 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.23 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  22.19 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.39 
 
 
418 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
452 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  27.23 
 
 
417 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  19.78 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  29.23 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  25.17 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 
421 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  20.91 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  21.99 
 
 
438 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.07 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  22.57 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.63 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.01 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  21.39 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  23.16 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  19.45 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  19.45 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  20.64 
 
 
387 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 
445 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.57 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.83 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.57 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  21.88 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  22.75 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  22.75 
 
 
393 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  24.65 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  22.38 
 
 
426 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>