205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0854 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  72.34 
 
 		 442 aa  640    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  74.13 
 
 		 460 aa  689    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  100 
 
 		 432 aa  869    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  73.28 
 
 		 464 aa  685    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  74.14 
 
 		 464 aa  694    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  74.35 
 
 		 460 aa  690    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  77.24 
 
 		 426 aa  666    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  66.9 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  36.8 
 
 		 409 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  33.82 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.67 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  28.26 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.3 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.24 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  126  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.06 
 
 		 412 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 407 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 392 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 392 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.69 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.26 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.6 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.54 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.93 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.93 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.93 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.93 
 
 		 423 aa  100  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 398 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  25.81 
 
 		 397 aa  91.7  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  22.06 
 
 		 417 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 424 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.38 
 
 		 381 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  23.71 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  23.97 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  23.97 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  23.97 
 
 		 395 aa  82.8  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.62 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.4 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.93 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  24.11 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  23.65 
 
 		 395 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  23.39 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  23.14 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  23.14 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  23.14 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  23.14 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  23.14 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  23.14 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.05 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  23.57 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  23.57 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.23 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  23.97 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.55 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.55 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.23 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.62 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2748  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2924  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 514 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  19.2 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1258  major facilitator transporter  22.54 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2826  major facilitator transporter  20.93 
 
 		 514 aa  63.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2851  transporter, putative  22.48 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1505  transporter, putative  21.22 
 
 		 514 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2875  major facilitator transporter  20.33 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0914  major facilitator transporter  20.77 
 
 		 511 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  23.18 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  23.8 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1331  major facilitator transporter  21.97 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  23.6 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  23.35 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  23.35 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3017  major facilitator superfamily MFS_1  21.68 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.227562  normal  0.425104 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1341  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  22.61 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.86 
 
 		 393 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  33.55 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  29.61 
 
 		 396 aa  58.5  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  23.79 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>