263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1458 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  810    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  39.7 
 
 		 412 aa  299  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  37.22 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 420 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.52 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 450 aa  122  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 412 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.69 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.41 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.4 
 
 		 432 aa  106  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 412 aa  103  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 416 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 417 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  26.11 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  26.11 
 
 		 397 aa  96.3  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25 
 
 		 397 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  28.22 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 428 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.75 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  24.75 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 424 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  24.36 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.75 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  23.65 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 399 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  23.65 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  23.3 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 416 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.41 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  24.4 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 414 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.86 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  25.19 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 452 aa  69.3  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.79 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  24 
 
 		 399 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  24.56 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.51 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 424 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.79 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  24.04 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  26 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  24.79 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  23.71 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  23.67 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  23.67 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  23.71 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.23 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.74 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  25 
 
 		 387 aa  62.8  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.67 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  23.86 
 
 		 418 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>