150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1629 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1629  putative MFS-type transporter YdeE  100 
 
 
395 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1688  putative MFS-type transporter YdeE  100 
 
 
395 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.165039  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1621  putative MFS-type transporter YdeE  99.75 
 
 
395 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.314977  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1654  putative MFS-type transporter YdeE  99.75 
 
 
395 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00100245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  78.23 
 
 
395 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01493  predicted transporter  77.47 
 
 
395 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.045441  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01504  hypothetical protein  77.47 
 
 
395 aa  595  1e-169  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.054912  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1623  putative MFS-type transporter YdeE  77.47 
 
 
395 aa  596  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000326131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1742  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 
395 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0931308  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 
395 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1630  putative MFS-type transporter YdeE  77.22 
 
 
395 aa  593  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0579751  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2112  major facilitator superfamily MFS_1  76.96 
 
 
395 aa  590  1e-167  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000539855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  71.94 
 
 
397 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  40.84 
 
 
393 aa  261  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  40.84 
 
 
393 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  40.84 
 
 
393 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  41.24 
 
 
407 aa  259  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  32.96 
 
 
381 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  33.42 
 
 
392 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  31.98 
 
 
404 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
392 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  29.76 
 
 
406 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.65 
 
 
417 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  29.11 
 
 
405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  27.27 
 
 
395 aa  108  1e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.32 
 
 
423 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  26.78 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.28 
 
 
413 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  25.14 
 
 
416 aa  97.8  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.27 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  24.73 
 
 
412 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.63 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.63 
 
 
423 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.88 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.88 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.88 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.88 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.46 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  23.76 
 
 
424 aa  86.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  24.57 
 
 
423 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  23.91 
 
 
432 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  25.55 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.57 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.56 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  23.5 
 
 
460 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.81 
 
 
424 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  23.35 
 
 
427 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.47 
 
 
424 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.88 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  23.87 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  24.37 
 
 
409 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 
445 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.83 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  23.08 
 
 
407 aa  67  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.32 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 
419 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 
421 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  23.31 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  23.31 
 
 
416 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 
391 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  24.51 
 
 
419 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.06 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2239  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0181769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.42 
 
 
450 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  21.49 
 
 
419 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 
410 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  25.26 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  24.16 
 
 
396 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.01 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.01 
 
 
412 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  21.45 
 
 
409 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
412 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5044  major facilitator transporter  23.14 
 
 
403 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183022  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  26.92 
 
 
464 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 
406 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  20.82 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  24 
 
 
401 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.81 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  22.65 
 
 
398 aa  53.5  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  23.29 
 
 
412 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  23.42 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  21.14 
 
 
412 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  21.11 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
376 aa  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  29.09 
 
 
419 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  22.47 
 
 
412 aa  49.7  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  22.06 
 
 
418 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  19.24 
 
 
417 aa  49.7  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  25.64 
 
 
386 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  22.7 
 
 
418 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  21.59 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  23.84 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  23.01 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>