More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06960 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  100 
 
 		 396 aa  786    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  46.29 
 
 		 404 aa  355  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 405 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  37.85 
 
 		 412 aa  252  7e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 		 420 aa  232  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  38.28 
 
 		 401 aa  228  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.82 
 
 		 423 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.5 
 
 		 407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 419 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  28 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 398 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 419 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 424 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 416 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 416 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  29.28 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.96 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.96 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 445 aa  99.4  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.74 
 
 		 423 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.01 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.83 
 
 		 402 aa  96.3  9e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.74 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.67 
 
 		 423 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  26.88 
 
 		 423 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.88 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.46 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.46 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.56 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.56 
 
 		 397 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.15 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.56 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.3 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.61 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.58 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.3 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.3 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.56 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  26.58 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  26.09 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  26.92 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.59 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  27.84 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.77 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.2 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  25.82 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.81 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  24.18 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  26.3 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  22.6 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  26.64 
 
 		 402 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 407 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  27.07 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  26.82 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 426 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  24.27 
 
 		 418 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  23.75 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  23.56 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 485 aa  63.2  0.000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 398 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>