138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0713 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0329  sugar efflux transporter, putative  84.29 
 
 
402 aa  667    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0697  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  804    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0713  major facilitator transporter  100 
 
 
404 aa  804    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000944208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3409  sugar efflux transporter A  30 
 
 
393 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2940  sugar efflux transporter A  30 
 
 
393 aa  150  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3539  sugar efflux transporter  29.73 
 
 
393 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2537  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
411 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.224335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3234  sugar efflux transporter  28.65 
 
 
409 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000446244 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00072  broad specificity sugar efflux system  28.5 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0618  sugar efflux transporter  29.17 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00071  hypothetical protein  28.5 
 
 
392 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4014  sugar efflux transporter C  27.13 
 
 
394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03542  predicted sugar efflux system  27.13 
 
 
394 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0046  sugar efflux transporter  27.13 
 
 
394 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3528  sugar efflux transporter  28.24 
 
 
392 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03484  hypothetical protein  27.13 
 
 
394 aa  141  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0075  sugar efflux transporter A  27.99 
 
 
392 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3871  sugar efflux transporter C  27.13 
 
 
394 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4166  sugar efflux transporter C  27.13 
 
 
394 aa  141  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0041  sugar efflux transporter  27.13 
 
 
394 aa  141  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3587  sugar efflux transporter  27.99 
 
 
392 aa  140  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000416053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0073  major facilitator superfamily sugar transporter  28.24 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1163  major facilitator transporter  27.27 
 
 
415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.235509 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2427  sugar efflux transporter  29.41 
 
 
393 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0194  major facilitator transporter  27.74 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4114  sugar efflux transporter C  26.8 
 
 
344 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2330  sugar efflux transporter  29.3 
 
 
392 aa  129  6e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.99673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0740  sugar efflux transporter  30.16 
 
 
399 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.797465  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1233  major facilitator transporter  27.61 
 
 
381 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0103633  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1922  sugar efflux transporter  28.37 
 
 
392 aa  123  4e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0164772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0064  sugar efflux transporter A  26.94 
 
 
360 aa  123  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1651  sugar efflux transporter  27.82 
 
 
392 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0566929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2764  sugar efflux transporter  29.81 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.846637  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1339  major facilitator superfamily sugar efflux pump  24.62 
 
 
456 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2445  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 
393 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.190665  hitchhiker  0.000000169528 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2356  sugar efflux transporter B  28.69 
 
 
393 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000027927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2401  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 
393 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0487824  hitchhiker  0.0000630797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2447  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 
393 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.018902  normal  0.791409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2559  sugar efflux transporter B  28.49 
 
 
393 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0168132  hitchhiker  0.000108533 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3308  sugar efflux transporter B  27.92 
 
 
393 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000181486  normal  0.0175789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2319  sugar efflux transporter B  27.92 
 
 
393 aa  106  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000297031  hitchhiker  0.00120871 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0792  sugar efflux transporter B  27.92 
 
 
393 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000601589  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02099  lactose/glucose efflux system  27.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.131835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1488  sugar efflux transporter  27.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116753  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02058  hypothetical protein  27.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.175397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2308  sugar efflux transporter B  27.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000102092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2468  sugar efflux transporter B  27.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000203316  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1478  sugar efflux transporter  27.64 
 
 
393 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000191341  hitchhiker  0.0000212529 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5278  major facilitator superfamily MFS_1  24.6 
 
 
444 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.804388  normal  0.835878 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0880  hypothetical protein  26.15 
 
 
404 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00224194  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4174  major facilitator transporter  23.86 
 
 
433 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3834  sugar efflux transporter  23.4 
 
 
371 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5291  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 
397 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6328  major facilitator transporter  25.39 
 
 
431 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769672  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4876  major facilitator transporter  23.83 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3289  major facilitator transporter  23.83 
 
 
431 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6028  major facilitator transporter  24.01 
 
 
431 aa  97.1  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.320097  normal  0.669923 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2547  major facilitator transporter  25.31 
 
 
402 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00906  major facilitator family protein  24.61 
 
 
359 aa  82  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0897  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  26.97 
 
 
396 aa  75.9  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0783  major facilitator superfamily MFS_1  24.15 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374247  normal  0.125612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2508  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00018254  hitchhiker  0.00122667 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6620  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 
399 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397819  normal  0.21382 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2776  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 
406 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00570116  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1027  hypothetical protein  30.6 
 
 
160 aa  58.9  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0911644  hitchhiker  0.0000959225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1478  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.311538  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5677  major facilitator superfamily MFS_1  21.36 
 
 
407 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813519  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 
415 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 
424 aa  53.5  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31250  Major Facilitator Superfamily transporter  25.95 
 
 
392 aa  53.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229188  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0127  major facilitator superfamily permease  24.14 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0361045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.3 
 
 
423 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2319  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 
407 aa  50.8  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
439 aa  50.8  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4655  major facilitator transporter  24.04 
 
 
403 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.347673  normal  0.129123 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1645  major facilitator superfamily permease  24.02 
 
 
409 aa  50.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0133  major facilitator transporter  30.07 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3314  major facilitator transporter  25 
 
 
455 aa  49.7  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000092062  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  23.78 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.53 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  24.01 
 
 
415 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.21 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0639  major facilitator transporter  25.63 
 
 
455 aa  48.9  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000191567  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6405  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 
437 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
387 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6253  MFS permease  22.67 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  25.68 
 
 
397 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  26.92 
 
 
391 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  26.23 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.51 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  28.95 
 
 
397 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  28.17 
 
 
386 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
414 aa  46.6  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  24.45 
 
 
401 aa  46.6  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  25.12 
 
 
412 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  21.39 
 
 
388 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>