140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1849 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  796    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  37.59 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  35.54 
 
 		 410 aa  250  4e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  37.7 
 
 		 400 aa  243  5e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  34.69 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  32.14 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  31.89 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  31.74 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  31.74 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  33.17 
 
 		 404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  31.63 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  31.63 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  31.63 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  31.63 
 
 		 397 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 397 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  31.89 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  31.81 
 
 		 401 aa  199  5e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  23.66 
 
 		 424 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  21.15 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  21.88 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  21.85 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  21.85 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  21.85 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  21.85 
 
 		 423 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.21 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  22.46 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  22.44 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  23.8 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  27.07 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  21.18 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  23.04 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  21.88 
 
 		 424 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  23.01 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.74 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  21.25 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  26.69 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  19.85 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  20 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  20 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  22.25 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  19.39 
 
 		 412 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.99 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  21.07 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  21.78 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  21.78 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.1 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  19.49 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  21.15 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.23 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.21 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  20.49 
 
 		 423 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.48 
 
 		 418 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 412 aa  53.5  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3789  efflux transporter, putative  23.55 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0557908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.23 
 
 		 418 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  19.49 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  20.42 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  22.13 
 
 		 407 aa  52.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000114988  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 452 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 416 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  21.95 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.69 
 
 		 412 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  24.69 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  21.76 
 
 		 405 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  19.33 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8042  major facilitator superfamily MFS_1  21.41 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.49 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  19.94 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  19.94 
 
 		 393 aa  49.7  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1776  arabinose efflux permease  27.5 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0105675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  19.77 
 
 		 393 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4004  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.29 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.074494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1932  hypothetical protein  21.53 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.629328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4300  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.71 
 
 		 504 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  23.34 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  19.89 
 
 		 395 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  19.6 
 
 		 398 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>