155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3092 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
422 aa  834    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  57.86 
 
 
412 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 
435 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  29.25 
 
 
407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.81 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  28.61 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
445 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  120  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  28.23 
 
 
423 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.95 
 
 
424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  28.17 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  28.04 
 
 
423 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  28.04 
 
 
423 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  28.04 
 
 
423 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  28.04 
 
 
423 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.21 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.72 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  28.03 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.2 
 
 
423 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  27.65 
 
 
413 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
423 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  28.49 
 
 
450 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
419 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
410 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.85 
 
 
424 aa  100  7e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  26.11 
 
 
432 aa  99.8  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  25.54 
 
 
416 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  24.65 
 
 
419 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  24.48 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
433 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  25.61 
 
 
471 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.63 
 
 
423 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  26.04 
 
 
412 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.28 
 
 
396 aa  83.2  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.21 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.48 
 
 
395 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  25.76 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
405 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  25.31 
 
 
412 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 
428 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  23.82 
 
 
417 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.21 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  27 
 
 
405 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  25.43 
 
 
381 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.09 
 
 
423 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  25.88 
 
 
452 aa  67  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  27.69 
 
 
434 aa  66.6  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.54 
 
 
393 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  25.84 
 
 
402 aa  63.5  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  22.25 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  22.25 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  21.81 
 
 
400 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0485  major facilitator superfamily MFS_1  22.81 
 
 
485 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.165691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.97 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.36 
 
 
421 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  21.75 
 
 
393 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 
401 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  21.69 
 
 
395 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  26.65 
 
 
392 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  23.84 
 
 
425 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  27.22 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  22.12 
 
 
398 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  21.6 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25.4 
 
 
414 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 
408 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  23.72 
 
 
416 aa  55.5  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  26.38 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.89 
 
 
409 aa  53.9  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
392 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2309  major facilitator transporter  25.8 
 
 
426 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  22.12 
 
 
399 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0953  major facilitator transporter  27.92 
 
 
412 aa  53.1  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  26.18 
 
 
433 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  22.19 
 
 
418 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  24.16 
 
 
417 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
417 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  20.17 
 
 
404 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  25.49 
 
 
415 aa  51.2  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.9 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.9 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  20 
 
 
404 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  20 
 
 
412 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  20 
 
 
412 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.58 
 
 
393 aa  50.1  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  22.91 
 
 
419 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  23.79 
 
 
438 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4586  major facilitator transporter  25.8 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101779  decreased coverage  0.00026814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  20.42 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2034  major facilitator transporter  24.66 
 
 
386 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  20.94 
 
 
418 aa  48.9  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>