213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1319 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  100 
 
 		 404 aa  809    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  84.51 
 
 		 393 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  84.51 
 
 		 393 aa  646    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  52.86 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  52.6 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  52.86 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  52.6 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  52.86 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  52.6 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  52.86 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  52.86 
 
 		 397 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  52.2 
 
 		 397 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  52.48 
 
 		 397 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  52.6 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  46.31 
 
 		 397 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  37.89 
 
 		 416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  33.17 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 407 aa  215  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0144  major facilitator superfamily permease  33.79 
 
 		 438 aa  211  3e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00484994  normal  0.343397 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2014  major facilitator superfamily permease  30.39 
 
 		 410 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0136  major facilitator superfamily permease  29.2 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  24.44 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 405 aa  86.7  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  25.06 
 
 		 396 aa  84  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.1 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.1 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  23.97 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25.13 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.39 
 
 		 423 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.93 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  20.63 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.2 
 
 		 423 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  23.16 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  21.37 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  23.92 
 
 		 418 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48630  putative MFS transporter  23.18 
 
 		 409 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0171421  normal  0.0121812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  25.09 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 418 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  24.13 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  24.13 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  23.02 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  24.73 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  24.14 
 
 		 418 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  21.91 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.62 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 412 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  23.88 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  23.43 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.42 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  24.73 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.42 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 450 aa  64.3  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  24.79 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  20.9 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0753  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  21.8 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.87 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  25.99 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  25.58 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  22.17 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  21.47 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  20.92 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  22.65 
 
 		 412 aa  57  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  21.84 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  21.07 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  21.11 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 420 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.3 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  20.31 
 
 		 460 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  20.55 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  21.63 
 
 		 432 aa  54.7  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  22.42 
 
 		 417 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>