195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3480 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  39.12 
 
 		 412 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 405 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  38.28 
 
 		 396 aa  242  9e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 404 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 		 419 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.75 
 
 		 407 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 445 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 450 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 424 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.33 
 
 		 424 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  25.46 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 424 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 398 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  25.59 
 
 		 450 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.87 
 
 		 423 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  26.6 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 423 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.53 
 
 		 423 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.72 
 
 		 423 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  27.2 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.39 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  27.3 
 
 		 423 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 410 aa  96.7  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  22.63 
 
 		 419 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 413 aa  90.1  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2132  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3364  hypothetical protein  26.84 
 
 		 397 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  26.25 
 
 		 393 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3387  hypothetical protein  26.06 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1861  hypothetical protein  26.55 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.25 
 
 		 393 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  27.43 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  27.43 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3391  major facilitator family protein  26.87 
 
 		 399 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.271693  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.05 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  26.84 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  25.25 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.25 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.25 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  25.25 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.25 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.25 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.25 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 		 415 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0996  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.825084  normal  0.507459 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.85 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.14 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  20.38 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.81 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  23.42 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.32 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 397 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  25.25 
 
 		 397 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  22.25 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  23.17 
 
 		 407 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  21.84 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  21.35 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.77 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  23.7 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  24.12 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  19.63 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  22.15 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  22.53 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 417 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1231  major facilitator superfamily permease  26.91 
 
 		 401 aa  57.4  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  21.58 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  24.3 
 
 		 416 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1882  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 411 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.123167  hitchhiker  0.000918142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  20.32 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  23.77 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 364 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>