231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0376 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 405 aa  292  8e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 404 aa  259  9e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 401 aa  252  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  31.4 
 
 		 407 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 398 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 		 419 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 419 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 395 aa  116  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  27.64 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 445 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  26.83 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  27.7 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  27.67 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 423 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.17 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  26.42 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.19 
 
 		 424 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.81 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  24.88 
 
 		 432 aa  93.2  7e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.27 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.27 
 
 		 397 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.27 
 
 		 397 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  24.27 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  24.27 
 
 		 397 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.07 
 
 		 419 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  24.01 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  24.01 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  23.75 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 397 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 393 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  26.25 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1571  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  24.01 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  29.32 
 
 		 402 aa  69.7  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  22.48 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2918  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3166  hypothetical protein  23.16 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0358769  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3416  hypothetical protein  23.16 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  22.02 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  20.27 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  22.43 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  21.23 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  21.23 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2181  multidrug resistance protein MdtH  22.12 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.815188  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  21.23 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 471 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1813  major facilitator superfamily permease  23.59 
 
 		 416 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000665519  hitchhiker  0.0000000329219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 423 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  23.9 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  22.42 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.47 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3060  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.24 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000191911  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4463  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.756392  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3150  membrane protein; TGF-beta receptor, type I/II extracellular region  23.24 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000153748  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0417  major facilitator transporter  24.63 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.117512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  23.47 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3386  hypothetical protein  22.31 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1579  multidrug resistance protein MdtH  23.61 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.6 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>