More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0572 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
410 aa  803    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  41.75 
 
 
450 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 
433 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  39.9 
 
 
450 aa  230  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  35.48 
 
 
412 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  37.75 
 
 
407 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
445 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  35.26 
 
 
419 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  35.13 
 
 
398 aa  190  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  30.02 
 
 
432 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  34.69 
 
 
416 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 
419 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  33.51 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  31.04 
 
 
413 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 
435 aa  139  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
412 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  28.74 
 
 
416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  29.11 
 
 
396 aa  117  5e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  26.79 
 
 
424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 
405 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  29.07 
 
 
420 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 
401 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  28.57 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 
415 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
426 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.4 
 
 
404 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.74 
 
 
423 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25 
 
 
423 aa  107  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  22.34 
 
 
424 aa  107  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.05 
 
 
423 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  26.51 
 
 
395 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  25.53 
 
 
423 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  24.4 
 
 
424 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
397 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.45 
 
 
402 aa  104  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
423 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.93 
 
 
423 aa  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
423 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.93 
 
 
423 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 
452 aa  99.8  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.85 
 
 
417 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  23.32 
 
 
424 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1849  major facilitator transporter  25.56 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1814  major facilitator transporter  25.56 
 
 
393 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.142704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25.79 
 
 
423 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
407 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.37 
 
 
419 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1319  drug transporter, putative  23.8 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.33 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4491  permease; multidrug resistance protein  26.52 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.341266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0385  putative permease  26.24 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4852  putative permease  25.97 
 
 
397 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.320137  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  21.5 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  25.97 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3416  major facilitator transporter  24.44 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0372119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4638  permease  25.97 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.3147  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4992  permease  25.97 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.976695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4883  permease, putative  26.24 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1849  major facilitator transporter  24.47 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  25.69 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  25.69 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  21.23 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  22.1 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4571  major facilitator transporter  24.1 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  22.1 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  20.61 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  20.61 
 
 
418 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  21.75 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  21.01 
 
 
418 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  21.43 
 
 
418 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  21.56 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  21.17 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  21.23 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.52 
 
 
434 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.03 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  25.19 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  26.79 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  22.55 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0013  major facilitator transporter  21.1 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1664  major facilitator superfamily MFS_1  24.64 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  24.02 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1994  putative MFS-type transporter YdeE  24.86 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.252393  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  22.52 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  24.13 
 
 
406 aa  69.7  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  25.13 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2148  putative MFS-type transporter YdeE  24.08 
 
 
395 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.355886  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  22.03 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  27.91 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  26.91 
 
 
454 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2124  putative MFS-type transporter YdeE  24.46 
 
 
395 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0942294  normal  0.976791 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  24.81 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>