151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2669 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2669  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 435 aa  846    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3092  major facilitator superfamily MFS_1  49.36 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.732045  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0785  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  28.34 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8266  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193695  normal  0.361913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 419 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7743  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 413 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0572  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 410 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  30.3 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 419 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05470  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120862  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1474  putative permease  25.59 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06960  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0334  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 450 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  24.08 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 423 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 423 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  24.72 
 
 		 423 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 395 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1664  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 428 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0767786 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  25 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3073  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 424 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2773  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 404 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.15201  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  24.43 
 
 		 423 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  23.1 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  26.38 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0571  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1458  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  22.89 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  21.53 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  22.89 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  23.31 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  22.53 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0376  major facilitator superfamily MFS_1  21.79 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.877089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  24.47 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0665  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  20.72 
 
 		 424 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 452 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  25.67 
 
 		 434 aa  59.7  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0299  major facilitator superfamily permease  24.51 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0324  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3480  major facilitator superfamily MFS_1  20.06 
 
 		 401 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2104  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 573 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.437602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  20.34 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  21.51 
 
 		 426 aa  53.9  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  19.36 
 
 		 412 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5777  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 417 aa  53.1  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.5 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  19.36 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.4 
 
 		 479 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  21.32 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0381  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 407 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000107075  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0659  major facilitator superfamily MFS_1  23.24 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.416429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  20.05 
 
 		 412 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0726  4-hydroxybenzoate transporter  28.05 
 
 		 455 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  20.55 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4613  amino acid/peptide transporter  25.47 
 
 		 445 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 414 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2388  major facilitator transporter  24.05 
 
 		 573 aa  50.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.729986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  20.71 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  18.82 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  18.82 
 
 		 412 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  23.91 
 
 		 405 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0273  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  28.01 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  31.11 
 
 		 498 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  23.12 
 
 		 381 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  21.11 
 
 		 460 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4972  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.702579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1037  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  30.43 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  21.02 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  21.02 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  32.2 
 
 		 461 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  21.02 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  29.23 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2598  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 575 aa  47.4  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.823661  normal  0.545914 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  20.17 
 
 		 404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4715  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  31.36 
 
 		 461 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  19.84 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>